Не-референтне мРНА секвенцинг-нгс
Карактеристике
● Снимање Поли МРНА пре припреме библиотеке
● Независно од било којег референтног генома: засновано на де Ново Скупштини транскрипата, генерисање листе Унигена који су назначени са више база података (НР, Свисс-Прот, ЦОГ, КОГ, Еггног, ПФАМ, Го, КЕГГ)
● Свеобухватна биоинформатична анализа експресије гена и структуре транскрипта
Предности услуга
●Опсежна стручност: Са записом за прераду прераде преко 600.000 узорака на БМКГЕН-у, који се протеже различитим врстама узорка, као што су ћелијске културе, ткива и телесне течности, наш тим доноси богатство искуства сваког пројекта. Успешно смо затворили преко 100.000 МРНА-СЕК пројеката у различитим истраживачким доменама.
●Строго контрола квалитета: Имолишемо основне контролне тачке у свим фазама, од узорка и припреме библиотеке у секвенцирање и биоинформатику. Ово пажљиво надгледање осигурава испоруку константних резултата високог квалитета.
● Свеобухватна напомена: Користимо више база података да функционално напомене различито изражени гени (дег) и обављају одговарајућу анализу обогаћивања, пружајући увид у ћелијске и молекуларне процесе у основи транскриптора.
●Подршка за после продаје: Наша посвећеност се проширује изван завршетка пројекта са тромесечном роком након продаје. За то време нудимо праћење пројекта, помоћ у решавању помоћи и питања и питања и питања за решавање било којег упита везаних за резултате.
Узорак захтева и испорука
| Библиотека | Стратегија за секвенцирање | Препоручује се подаци | Контрола квалитета |
| Поли обогаћен | Иллумина пе150 ДНБСЕК-Т7 | 6-10 ГБ | К30≥85% |
Узорак захтева:
Нуклеотиди:
| Конц. (НГ / μЛ) | Износ (μг) | Чистоћа | Интегритет |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | ОД260 / 280 = 1,7-2.5 ОД260 / 230 = 0.5-2.5 Ограничена или без загађења протеина или ДНК приказана на гелу. | За биљке: РИН≥4.0; За животиње: РИН≥4.5; 5.012С / 18С≥1.0; Ограничена или без основне висине |
● Биљке:
Корен, стабљика или латица: 450 мг
Лист или семе: 300 мг
Воће: 1,2 г
● Животиња:
Срце или црева: 300 мг
Висцера или мозак: 240 мг
Мишус: 450 мг
Кости, коса или кожа: 1Г
● Артроподс:
Инсекти: 6г
Црустацеа: 300 мг
● цела крв: 1 цев
● ћелије: 106 ћелије
Препоручена испорука узорка
Контејнер: 2 мл Центрифуга цев (Тин фолија се не препоручује)
Означавање узорка: Група + поновна реликација, нпр. А1, А2, А3; Б1, Б2, Б3.
Пошиљка:
1. суви лед: узорци морају бити упаковани у кесе и закопане у сувом леду.
2 РНАПДАБЛЕ ЦЕПОВЕ: РНА узорци се могу осушити у цијеви РНА стабилизације (нпр. Рнастабле®) и испоручује се на собној температури.
Сервисни радни проток
Дизајн експеримента
Достава узорака
РНА екстракција
Изградња библиотеке
Секвенцирање
Анализа података
Услуге након продаје
Биоинформатика
Одабир транскрипта и изборне селекције
Унигенска напомена
Корелација узорака и процена биолошких реплике
Различити изражени гени (дег)
Функционална напомена дег
Функционално обогаћивање дег
Истражите напредне напредне БМКГене-ове еукариотске НГС услуге РРНА Секвенцирање кроз курирану збирку публикација.
Схен, Ф. ет ал. (2020) 'Де Ново транскрипсни скуп и експресија гена за сексуалну пристрасност у гонадима Амур сома (силурус асотус)', геномика, 112 (3), стр. 2603-2614. Дои: 10.1016 / Ј.ИГЕНО.2020.01.026.
Зханг, Ц. ет ал. (2016) 'Транскриптна анализа метаболизма сахарозе Током отеклине и развоја сијалица у луку (аллиум цепа Л.), границе у биљној науци, 7 (септембар), стр. 212763. Дои: 10.3389 / ФПЛС.2016.01425 / БИБТЕКС.
Зху, Ц. ет ал. (2017) 'Де Ново Скупштина, карактеризација и напомена за транскрипт саркохеилицхтхис синенсис', плос један, 12 (2). Дои: 10.1371 / часопис.Поне.0171966.
ЗОУ, Л. Ет ал. (2021) 'Де Ново транскрипсана анализа пружа увид у толеранцију соли Подоцарпус макрофиллус под стресом сланости ", БМЦ Биљна биологија, 21 (1), стр. 1-17. Дои: 10.1186 / С12870-021-03274-1 / Фигуре / 9.
