Секвенцирање транскриптома пуне дужине засновано на нанопорама
Секвенцирање нанопора се разликује од других платформи за секвенцирање, по томе што се нуклеотиди читају директно без синтезе ДНК и генерише дуга читања на десетинама килобаза. Ово омогућава директно читање транскрипта у пуној дужини и суочавање са изазовима у транскриптомским студијама.
√ Ниска пристрасност специфична за секвенцу
√ Читање цДНК пуне дужине за студије структуре гена
√ Потребно је мање података за покривање истог броја транскрипата
√ Идентификација више изоформи по гену
√ Квантификација експресије на нивоу изоформе
Типични биоинформатички цевовод
Најновији успешни случајеви са Биомаркер технологијама
1. Упоредне анализе транскриптома пуне дужине откривају динамику развоја стабла Гнетум луофуенсе
Часопис: Границе у генетици
Објављено: март 2021
Кључне речи: МинИОН | Алтернативно спајање | АПА | лнцРНА | Диференцијално изражени транскрипти
Прочитајте цео текст
2. Једносмерно кретање малих РНК од изданака до корена у интерспецифичним хетерографтима
Часопис: Природа Биљке
Објављено: јануар 2021
Кључне речи: Нанопоре | Иллумина | детекција мобилне мРНА пуне дужине
3. Целокупна транскриптомска анализа корена шпаргле открива молекуларни механизам толеранције соли изазван арбускуларним микоризним гљивама
Часопис: Еколошка и експериментална ботаника
Објављено: јануар 2021
Кључне речи: МинИОН | Диференцијално изражени транскрипти | Транскрипцијски фактори | Алтернативно спајање
4. Промене физиолошких карактеристика и транскриптом целе дужине корена и листова руже (Роса цхиненсис) као одговор на стрес од суше
Часопис: Физиологија биљака и ћелија
Објављено: октобар 2020
Кључне речи: ПрометхИОН | Диференцијално изражени транскрипти | Функционално предвиђање | Спојене изоформе | ТФ и лнцРНА
5. Анализа и свеобухватно поређење ПацБио и секвенцирања РНК на бази нанопора транскриптома Арабидопсис
Часопис: Плант Метход
Објављено: април 2020
Кључне речи: ГридИОН | ПрометхИОН | ПацБио Секуел | Иллумина НоваСек | Поравнање генома | Идентификација транскрипта | Алтернативно спајање | ССР | ЛнцРНА | Квантификација изоформе
Вести и најважније ствари има за циљ да подели најновије успешне случајеве са Биомаркер Тецхнологиес, ухвати нова научна достигнућа, као и истакнуте технике примењене током студије.
Време поста: Јан-08-2022