Скупштина генома Т2Т, ГЕНОМЕ ГЕНОМЕ БЕСПЛАТНО
1stДва генома риже1
Наслов: Скупштина и валидација ДВА референтних генома без празнина за КСИАН / Индица Рице открива увид у архитектуру биљне центаре
Дои:хттпс: //дои.орг/10.1101/2020.12.24.424073
Постављено време: 01. јануара 2021. године.
Институт: Хуазхонг Пољопривредни универзитет, Кина
Материјалирати
О. Сатива Ксиан / ИндицаРице сорте 'Зхенсхан 97 (ЗС97)' и 'Мингхуи 63 (МХ63)
Стратегија за секвенцирање
Нгс гласи + хиФи гласи + ЦЛР гласи + Бионано + хи-ц
Подаци:
ЗС97: 8,34 ГБ (~ 23к) ХиФи гласи + 48,39 ГБ (~ 131к) ЦЛР гласи + 25 ГБ (~ 69к) НГС + 2 ћелије бионано ириса
МХ63: 37.88 ГБ (~ 103к) ХиФи гласи + 48,97 ГБ (~ 132к) ЦЛР гласи + 28 ГБ (~ 76к) НГС + 2 Бионано ирис ћелије
Слика 1 Два генома без размака риже (МХ63 и ЗС97)
2ndГЕНОМА БАНАНА2
Наслов: Теломере-теломере без гребена хромозоми банане користећи нанопоре секвенцирање
Дои:хттпс: //дои.орг/10.1101/2021.04.16.440017
Постено време: 17. априла 2021.
Институт: Университе Парис-Сацлаи, Француска
Материјалирати
Двоструко хаплоидМуса Ацуминатасппмалакцијски(ДХ-Паханг)
Стратегија и подаци о секвенцирању:
ХИСЕК2500 ПЕ250 МОДЕ + МИНИОН / ПРОМЕТИОН (93ГБ, ~ 200Кс) + оптичка мапа (ДЛЕ-1 + БСПК1)
Табела 1 Поређење скупштина Муса Ацумината (ДХ-Паханг)
Слика 2 Поређење архитектуре Муса Геномес
3rdФАЕОДАЦТИЛУМ ТРИЦОРРУТУМ ГЕНОМЕ3
Наслов: Теломеро-ТЕИТЕРЕ ГЕНОМЕ САСТАВАP
хаеодактилум трицорнутум
Дои:хттпс: //дои.орг/10.1101/2021.05.04.442596
Постављено време: 04. маја 2021
Институт: Западни универзитет, Канада
Материјалирати
Пхаеодактилум трицорнутум(Збирка културе алге и протозоа ЦЦАП 1055/1)
Стратегија и подаци о секвенцирању:
1 ОКСФОРД НАНОПОРЕ МИНИОН ЦОТЛИЦЕ + А 2 × 75 УПОТРЕБА СРЕДЊА МИД-ИЗЛАЗА НЕКСТРЕДЕК 550 РУН
Слика 3 Ворк ток за склоп ГЕНОМЕ ТЕЛОМЕРЕ ТО ТЕЛОМЕРЕ
4thХуман ЦХМ13 генома4
Наслов: Комплетан редослед људског генома
Дои:хттпс: //дои.орг/10.1101/2021.05.26.445798
Постављено време: 27. маја 2021
Институт: Национални институти за здравље (НИХ), САД
Материјали: ћелијска линија ЦХМ13
Стратегија и подаци о секвенцирању:
30 × ПАЦБИО КРУГАРСКО КУИЛСКЕ РЕЗЕРВЕ (ХИФИ), 120 × ОКСФОРД НАНОПОРЕ УЛТРА-ЛОНГ РУНД РУКОВИНГ, 100 × ИЛЛУМИНА ПЦР-ФРЕЕ Секвенцинг (ИЛМН), 70 × Иллумина / Арима ГЕНОМИКА ХИ-Ц (ХИ-Ц), Бионано оптичке мапе, и странд-сек
Табела 2 Поређење Скупштина Хуман Генома Хуман Геномес Скупштине ГРЦХ38 и Т2Т-ЦХМ13
Референца
1.Сергеи Нурк ет ал. Комплетан редослед људског генома. Биоркив 2021.05.26.445798; Дои:хттпс: //дои.орг/10.1101/2021.05.26.445798
2.Аролине Белсер ет ал. Теломере-теломере без грејаве хромозоми банане користећи нанопоре секвенцирање. Биоркив 2021.04.16.440017; Дои:хттпс: //дои.орг/10.1101/2021.04.16.440017
3.Даниел Ј. Гигуере ет ал. Теломерово о технолошком окупљању АКТИВЕРА ПХАЕОДАЦТИНУМ ТРИЦОРУТУМ. Биоркив 2021.05.04.442596; Дои:хттпс: //дои.орг/10.1101/2021.05.04.442596
4.јиа-Минг Сонг ет ал. Скупштина и валидација два референтна генома без празнина за пиринач Ксиан / Индица открива увид у архитектуру биљке Центромере. Биоркив 2020.12.24.424073; Дои:хттпс: //дои.орг/10.1101/2020.12.24.424073
Вријеме поште: Јан-06-2022