Комплексне и варијабилне алтернативне изоформе у организмима су важни генетски механизми за регулисање експресије гена и разноврсности протеина. Тачна идентификација структура транскрипта је основа за дубинско проучавање образаца регулације експресије гена. Платформа за секвенцирање нанопора успешно је довела транскриптомску студију на ниво изоформе. Ова платформа за анализу је дизајнирана да анализира РНА-Сек податке генерисане на Нанопоре платформи на основу референтног генома, чиме се постижу квалитативне и квантитативне анализе и на нивоу гена и на нивоу транскрипта.
