Нанопоре Транскрипт са целом дужином

Нанопоре Транскрипт Секвенцирање је моћна метода за редослед цДНА-ова у целој дужини, тачно идентификовање и квантификацију изоформи транскрипта. Цевовод БМКЦлоуд Нанопоре целокупни транскрипмент дизајниран је за анализу података РНА-СЕК генерисаних на Нанопоре платформи против висококвалитетног доброг напонског референтног генома, пружајући квалитативну и квантитативну анализу и на нивоу гена и транскрипта. Након контроле квалитета добијају се у целости нехимерцијски (ФЛНЦ) секвенце и консензусне секвенце пресликавају се на референтни геном за уклањање редундантних транскрипата. Из овог сета транскрипта израз је квантификован и различито изражен ген и транскрипти су идентификовани и функционално означени. Нафтовод такође укључује анализу алтернативног полиаденилације (АПА), алтернативна анализа спајања, анализе једноставне секвенце (ССР), предвиђање ЛНЦРНА и одговарајућих циљева, предвиђање кодирајућих секвенци (ЦД-ови), анализу породице гена, анализа фактора транскрипције и функционална напомена транскрипата.