мРНА-сек (НГС) – Де ново

Секвенцирање мРНА омогућава профилисање свих транскрипата мРНК у ћелијама под специфичним условима и широко је коришћена технологија у различитим истраживачким областима. БМКЦлоуд Де ново мРНА-сек цевовод је дизајниран да анализира библиотеке секвенцирања обогаћених поли-А када референтни геном није доступан. Цевовод почиње контролом квалитета, а затим следиде новосклапање транскрипта и избор унигеног скупа. Анализа унигене структуре предвиђа кодирајућу секвенцу (ЦДС) и понављање једноставне секвенце (ССР). Након тога, анализа диференцијалне експресије проналази различито изражене гене (ДЕГ) међу тестираним условима, након чега следи функционална анотација и обогаћивање ДЕГ-а да би се извукли биолошки увиди.