метагеномика (НГС)

Метагеномика сачмарице са Иллумином је популарно средство за проучавање микробиома директним секвенционирањем ДНК из сложених узорака, омогућавајући проучавање и таксономске и функционалне разноликости. БМКЦлоуд метагеномски (НГС) цевовод почиње контролом квалитета и састављањем метагенома, из којих се гени предвиђају и групишу у нередундантне скупове података који су обележени за функцију и таксономију користећи више база података. Ове информације се користе за анализу таксономске разноликости унутар узорка (алфа разноликост) и разноликости између узорака (бета разноврсност). Диференцијална анализа између група проналази ОТУ и биолошке функције које се разликују између две групе користећи параметарске и непараметарске тестове, док корелациона анализа повезује ове разлике са факторима средине.