Анализа еукариотске мРНА (доступне опције засноване на референцама и нове опције)
Овај цевовод користи НГС РНА-Сек податке као улаз и производи резултате из више низводних анализа укључујући, али не ограничавајући се на: процену квалитета података секвенцирања,де новоанотација места транскрипције, анализа варијабилног спајања, анализа диференцијалне експресије, анотација функције и анализа обогаћивања.
Дуга некодирајућа РНК анализа
Дуге некодирајуће РНК (лнцРНА) су некодирајући транскрипти дужине веће од 200 нт и познато је да играју улогу у организацији и регулацији хроматина. Технологије секвенцирања високе пропусности и биоинформатика су оснажиле наше разумевање секвенци лнцРНА и информација о позиционирању да идентификујемо лнцРНА са кључним регулаторним функцијама. Овај цевовод обезбеђује анализу лнцРНА поред анализа поменутих у цевоводу за анализу еукариотске мРНА.
16С/18С/ИТС секвенцирање ампликона
Цијев за анализу микробне разноврсности Амплицон Секуенцинг развијен је на основу година искуства у анализи пројекта микробне разноврсности. Ценовник садржи стандардизовану основну анализу, која покрива главни садржај анализе тренутног микробног истраживања и персонализоване анализе. Извештај анализе је богат и свеобухватан, са могућношћу обављања различитих личних анализа. Поред тога, узорци и групе се могу мењати у ходу ради додатног прилагођавања и контроле.
Метагеномска анализа пушке
Цјевовод метагеномске анализе Схотгун користи НГС податке из мешовитих геномских материјала екстрахованих из узорака животне средине. Укључене анализе пружају детаљне информације о разноврсности и бројности врста, структури популације, филогенетском односу, функционалним генима и корелационим мрежама са факторима животне средине.
Анализа варијанти НГС-ВГС
Анализа варијанти НГС-ВГС је интегрисани цевовод за откривање варијанти који врши контролу квалитета података, поравнање секвенце, белешке и анализу генских мутација. Цевовод прати ГАТК најбоље праксе за СНП и ИнДел детекцију и користи Манта за позивање структурних варијанти.
Студија широке асоцијације генома (ГВАС)
ГВАС цевовод је низводна анализа која узима претходно генерисане ВЦФ датотеке и одговарајуће податке о фенотипу за групу појединаца као улаз. Користећи специфичне статистичке методологије, ГВАС има за циљ да открије варијације нуклеотида у целом геному које су у корелацији са фенотипским разликама. Он игра кључну улогу у истраживању функционалних гена повезаних са сложеним људским болестима и сложеним особинама биљака и животиња.
Групна анализа сегрегације (БСА)
БСА анализа укључује удруживање појединаца са екстремним фенотипским особинама из сегрегиране популације. Упоређивањем диференцијалних локуса између прикупљених узорака, овај приступ брзо идентификује уско повезане молекуларне маркере повезане са циљним генима. Широко коришћен у генетском мапирању биљака и животиња, он је драгоцено средство за узгој уз помоћ маркера.
Анализа еволуционе генетике
Радни ток еволуционе генетичке анализе користи БМКГЕНЕ-ово велико искуство у пројектима генетске еволуције и укључује изградњу филогенетског стабла, анализу неравнотеже веза, процену генетичке разноврсности, идентификацију селективног прегледа, анализу сродства, анализу главних компоненти и карактеризацију структуре популације.
