Еволуциона генетика
Предности услуга
Такаги ет ал.,Часопис постројења, 2013
●Свеобухватна биоинформатична анализа:Омогућавање процене генетске разноликости, што одражава еволуцијски потенцијал врста и откривање поузданог филогенетског односа између врста са минимизираним утицајем конвергентне еволуције и паралелне еволуције
●Опционална прилагођена анализа: Као што је процена времена дивергенција и брзине заснована на варијацијама на нивоу нуклеотида и аминокиселинама.
●Опсежна стручност и записе о објављивању: БМКГЕНЕ је накупљао масовно искуство у пројектима становништва и еволуционих генетика већ више од 15 година, који покривају хиљаде врста итд. И допринели су преко 1000 пројеката на високом нивоу објављеним у природним комуникацијама, молекуларним биљним часописима, часопису у постројењима, часопису Библићне биотехнологије итд.
● Високо вештки тим за биоинформатику и кратки циклус анализе: Са великим искуством у напредној анализи геномике, БМКгене је тим испоручује свеобухватне анализе брзином преокрета.
● Подршка након продаје:Наша посвећеност се проширује изван завршетка пројекта са тромесечним роком након продаје. За то време нудимо праћење пројекта, помоћ у решавању помоћи и питања и питања и питања за решавање било којег упита везаних за резултате.
Спецификације и захтеви услуга
| Врста секвенцирања | Препоручена скала популације | Стратегија за секвенцирање | Нуклеотидни захтеви |
| Целокупно секвенцирање генома | ≥ 30 појединаца, са ≥ 10 појединаца из сваке подгрупе
| 10к | Концентрација: ≥ 1 нг / μл Укупно износе 30нг Ограничена или без разградње или контаминације |
| Специфични локус појачан фрагмент (СЛАФ) | Дубина ознаке: 10к Број ознака: <400 МБ: Препоручује се ВГ <1ГБ: 100К ознаке 1ГБ > 2ГБ: 300К ознаке МАКС 500К ознаке | Концентрација ≥ 5 нг / μл Укупни износ ≥ 80 НГ Нанодроп од260 / 280 = 1.6-2.5 Агаросе гел: нема или ограничена деградација или контаминација
|
Сервисни радни проток
Дизајн експеримента
Достава узорака
Изградња библиотеке
Секвенцирање
Анализа података
Услуге након продаје
Услуга укључује анализу структуре становништва (филогенетско дрво, ПЦА, графикон о стратификацији становништва), разноликост становништва и избор становништва (селекција становништва) (неравнотежа популације (повезаност са селективним прегледом повољних локација). Услуга се такође може укључити прилагођена анализа (нпр. Време дивергенције, ток гена).
*Овде су приказани демо резултати су сви из генома објављених са БМКгене
1. Анализа анализе садржи изградњу филогенетског дрвета, структуре становништва и ПЦА на основу генетских варијација.
Филогенетско дрво представља таксономске и еволутивне везе међу врстама са уобичајеним претком.
ПЦА има за циљ да визуализује блискост између под-популација.
Структура становништва показује присуство генетски изразитог под-становништва у погледу алелних фреквенција.
Цхен, ет. ал.,Пна, 2020
2.Сесецтиве Свјет
Селективно се се односи на поступак којим се одабрана повољна локација и фреквенције повезане неутралне локације су повећане, а они од нетакнутих локација се смањују, што резултира смањењем регионалног.
Откривање широког генома на селективним регијама прерађује се израчунавањем генетских индекса становништва (π, ФСТ, Тајима д) свих СНП-а унутар клизног прозора (100 Кб) на одређеном кораку (10 КБ).
Нуклеотидна разноликост (π)
Тајима'с Д
Индекс фиксације (ФСТ)
Ву и ет. ал.,Молекуларна биљка, 2018
3.гене проток
Ву и ет. ал.,Молекуларна биљка, 2018
4.Демографска историја
Зханг и Ет. ал.,Екологија природе и еволуција, 2021
5. Временовање времена
Зханг и Ет. ал.,Екологија природе и еволуција, 2021
Истражите напредне напредности које омогућавају Еволуциона генетичка службама БМКГене-а кроз курирану колекцију публикација:
Хассаниар, АК и др. (2023) 'Откриће молекуларних маркера СНП и гена кандидата повезаних са сцорпроод отпором вируса у ларве АПИ ЦЕРАНА ЦЕРАНА ЦЕЛОМ ГЕНОМЕ РЕСТЕКЕНЦИЈА',Међународни часопис Молекуларне науке, 24 (7). Дои: 10.3390 / ИЈМС24076238.
Цхаи, Ј. Ет ал. (2022) 'Откриће дивљег, генетски чистог кинеског гиганта Саламандера ствара нове могућности очувања',Зоолошко истраживање, 2022, вол. 43, број 3, стр. 469-480, 43 (3), стр. 469-480. Дои: 10.24272 / Ј.ИССН.2095-8137.2022.101.
Хан, М. ет ал. (2022) 'Филогеографски образац и економичност становништва за аутохтоне Елимус Сибирицус Л. на Кингаи-Тибетански плато',Границе у биљној науци, 13, стр. 882601. Дои: 10.3389 / ФПЛС.2022.882601 / бибтек.
Ванг, Ј. Ет ал. (2022) 'ГЕНОМСКИ УЛИД НА ЛОНГАН ЕВОЛУЦИЈУ ОД ХРОМСКОЗИМА ГЕНОМСКОГ СКУПА И СТАНОВНИЦА ГЕНОМА ЛОНГАНА ПРИСТУПА',Хортикултура истраживања, 9. дои: 10.1093 / хр / ухац021.
