ДНБСЕК унапред направљене библиотеке
Карактеристике
●Платформа:МГИ-ДНБСЕК-Т7
●Режими секвенцирања:ПЕ150
●Пренос Иллумина библиотека уМГИ:омогућавање секвенцирања великих количина података по ниској цени.
●Контрола квалитета библиотека пре секвенцирања.
●КЦ секвенцирања података и испорука:испорука КЦ извештаја и необрађених података у фастк формату након демултиплексирања и филтрирања К30 читања.
Предности
●Разноврсност услуга секвенцирања:купац може да изабере редослед по траци или количини података.
●Високи излаз података:1500 Гб/трака
●Испорука секвенционалног КЦ извештаја:са метриком квалитета, прецизношћу података и укупним перформансама пројекта секвенцирања.
●Процес зрелог секвенцирања:са кратким временом преокрета.
●Ригорозна контрола квалитета: примењујемо строге захтеве за контролу квалитета како бисмо гарантовали испоруку конзистентно висококвалитетних резултата.
Захтеви за узорке
| Количина података (Кс) | Концентрација (кПЦР/нМ) | Волуме | |
| Партиал Лане
| Кс ≤ 10 Гб | ≥ 1нМ | ≥ 25 μл |
| 10 Гб < Кс ≤ 50 Гб | ≥ 2 нМ | ≥ 25 μл | |
| 50 Гб < Кс ≤ 100 Гб | ≥ 3 нМ | ≥ 25 μл | |
| Кс > 100 Гб | ≥ 4 нМ | ||
| Сингле Лане | Пер Лане | ≥ 1,5 нМ / фонд библиотеке | ≥ 25 μл / фонд библиотеке |
Поред концентрације и укупне количине, потребан је и одговарајући образац пикова.
Напомена: Секвенцирање трака библиотека ниске разноликости захтева ПхиКс спике-ин да би се обезбедило робусно позивање базе.
Препоручујемо да предате унапред обједињене библиотеке као узорке. Ако вам је потребан БМКГЕНЕ да изврши обједињавање библиотека, погледајте
захтеви библиотеке за делимично секвенцирање трака.
Величина библиотеке (мапа врха)
Главни врх треба да буде унутар 300-450 бп.
Библиотеке треба да имају један главни врх, без контаминације адаптера и без димера прајмера.
Ток рада услуге
Извештај КЦ библиотеке
Извештај о квалитету библиотеке се даје пре секвенцирања, процене количине библиотеке и фрагментације.
Секвенцирање КЦ извештаја
Табела 1. Статистика података о секвенцирању.
| ИД узорка | БМКИД | Сирова читања | Необрађени подаци (бп) | Чиста читања (%) | К20(%) | К30(%) | ГЦ(%) |
| Ц_01 | БМК_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| Ц_02 | БМК_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Слика 1. Расподела квалитета дуж очитавања у сваком узорку
Слика 2. Дистрибуција основног садржаја
Слика 3. Дистрибуција прочитаног садржаја у подацима секвенцирања
