●Платформе:Иллумина НоваСек 6000 и НоваСек Кс Плус
●Редослед реда:ПЕ150 и ПЕ250
●Контрола квалитета библиотека пре секвенцирања
●Подешавање података КЦ и достава:Испорука КЦ извештаја и РАВ података у Фастк формату након Демултиплексирања и филтрирања К30 гласи
●Свестраност секвенцирања услуга:Купац може одабрати да се секвенционалне траке, проточне ћелије или по потреби података потребне (делимично секвенцирање траке).
●Опсежно искуство на платформи за секвенцирање Иллумина:са хиљадама затворених пројеката са различитим врстама.
●Достава секвенцирања КЦ извештаја:Са квалитетним метричким метрима, тачност података и укупни извођење секвенцирајућих пројеката.
●Процес зрелог секвенцирања:са кратким временским временом.
●Строго контрола квалитета: Имолимо строге КЦ захтеве да гарантујемо испоруку константних резултата високог квалитета.
Платформа | Ћелија протока | Режим секвенцирања | Јединица | Процењени излаз |
НоваСек Кс | 10б (8 лана) | Пе150 | Једнократна трака Делимична трака | 375ГБ / ЛАНЕ |
25б (8 лана) | Пе150 | Једнократна трака Делимична трака | 1000 ГБ / ЛАНЕ | |
НоваСек 6000 | СП Флов Целл (2 трака) | ПЕ250 | Ћелија протока Једнократна трака Делимична трака | 325-400 м гласи / лане |
С4 ћелија протока (4 траке) | Пе150 | Ћелија протока Једнократна трака Делимична трака | ~ 800 ГБ / Лане |
Износ података (к) | Концентрација (КПЦР / Нм) | Запремина | |
Делимична секвенцирање траке
| Кс ≤ 10 ГБ | ≥ 1 нм | ≥ 25 ул |
10 ГБ <к ¥ 50 ГБ | ≥ 2 нм | ≥ 25 ул | |
50 ГБ <к ¥ 100 ГБ | ≥ 3 нм | ≥ 25 ул | |
К> 100 ГБ | ≥ 4 нм | ≥ 25 ул | |
Секвенцирање траке | По траци | ≥ 1.5 НМ / библиотечки базен | ≥ 25 ул / библиотечки базен |
Поред концентрације и укупног износа потребан је и одговарајући вршни узорци.
НАПОМЕНА: Редослед траке са ниским библиотекама разноликости захтева Пхик Спике-ин да би се осигурало робусно базну позивање.
Препоручујемо да се предрасуљене библиотеке предају као узорке. Ако вам је потребан БМКгене да извршите библиотеку, погледајте
Захтеви библиотеке за делимично секвенцирање траке.
Главни врх треба да буде у року од 300-450 бп.
Библиотеке би требало да имају један главни врх, нема контаминације адаптера и нема димера премаза.
Извештај о квалитету библиотеке предвиђен је пре секвенцирања, процене количине библиотеке и фрагментације.
Табела 1. Статистика о секвенцирању података.
ИД узорака | Бмкид | Сировита | РАВ ДАТА (БП) | Чисти гласи (%) | К20 (%) | К30 (%) | ГЦ (%) |
Ц_01 | Бмк_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
Ц_02 | Бмк_02 | 14.717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Слика 1. дистрибуција квалитета по гласима у сваком узорку
Слика 2. Дистрибуција основне садржаје
Слика 3. Дистрибуција садржаја за читање у секвенцирајућим подацима