ГЛАВНА АНАЛИЗА СЕГРЕНТАЊА
Предности услуга
Такаги ет ал., Пословни часопис, 2013
● Тачна локализација: мешање сива са 30 + 30 до 200 + 200 појединаца да би се минимизирала позадинска бука; Не-синонимно предвиђање кандидатског региона на бази кандидата.
● Свеобухватна анализа: Повећана Функција гена кандидата, укључујући НР, СвиссПрот, Го, КЕГГ, ЦОГ, КОГ итд.
● Брже време преокрета: Брза локализација гена у року од 45 радних дана.
● Опсежно искуство: БМК је допринео у хиљадама локализације особина, покривајући различите врсте попут усева, водених производа, шума, цвећа, плодова итд.
Спецификације услуга
Становништво:
Сегрегирајући потомство родитеља са супротним фенотиповима.
нпр. ф2 потомство, бацкцроссинг (пре нове ере), рекомбинантна инбред линија (РИЛ)
Базен за мешање
За квалитативне особине: 30 до 50 појединаца (минимум 20) / расути
За квантитативни ТРАТИС: Топ 5% на 10% појединаца са екстремним фенотиповима у целој популацији (најмање 30 + 30).
Препоручена дубина секвенцирања
Најмање 20к / родитељ и 1к / потомство појединца (нпр. За потомство мешајући базен од 30 + 30 појединца, дубина секвенцирања биће 30к по расути)
Биоинформатицс анализе
● Површило целокупно генома
● Обрада података
● СНП / Инзел зове
● Скрининг региона кандидата
● Функција кандидатске гене
Узорак захтева и испорука
Узорак захтева:
Нуклеотиди:
| ГДНА узорак | Узорак ткива |
| Концентрација: ≥30 НГ / μЛ | Биљке: 1-2 г |
| Износ: ≥2 μг (промена ≥15 ул) | Животиње: 0,5-1 г |
| Чистоћа: ОД260 / 280 = 1.6-2.5 | Цела крв: 1,5 мл |
Сервисни радни проток
Дизајн експеримента
Достава узорака
РНА екстракција
Изградња библиотеке
Секвенцирање
Анализа података
Услуге након продаје
1. База анализе анализе на еуклидској удаљености (ЕД) за идентификацију региона кандидата. На следећој слици
Кс-Оса: број хромозома; Свака тачка представља ед вредност СНП-а. Црна линија одговара уграђеној вредности ЕД-а. Већа вредност ЕД указује на значајнија удруживање између места и фенотипа. Ред Цртица линија представља праг значајног удружења.
2.Сассоциатион Анализа заснована није СНП-индекс
Кс-Оса: број хромозома; Свака тачка представља вредност СНП индекса. Црна линија означава постављену вредност СНП индекса. Што је вредност већа је, што је значајнија удружење.
БМК Цасе
Квантитативна особина мајоне-ефекта Локус ФНЛ7.1 кодира касну ембриогенезу обилне протеине повезане са дужином воћа у краставцу
Објављено: Часопис за биотехнологију биљака, 2020
Стратегија секвенцирања:
Родитељи (ЈИН5-508, ИН): Површина целог генома за 34 × и 20 ×.
ДНК базени (50 дугих врата и 50 кратких врата): РесЕКЦИрање за 61 × и 52 ×
Кључни резултати
У овој студији, сегрегирајуће становништво (Ф2 и Ф2: 3) је генерисано прелазним линијама краставца дугог врата ЈИН5-508 и кратким вратом ин. Два базена ДНК конструисане су 50 екстремних појединаца дугог врата и 50 екстремних појединаца кратких врата. КТЛ главни ефекат идентификован је на ЦХР07 БСА анализа и традиционалном КТЛ мапирању. Регион кандидата је додатно сужен фино мапирањем, квантификацијом и трансгеничним експериментима гена, који су открили кључни ген у контролној дужини, ЦСФНЛ7.1. Поред тога, утврђено је да полиморфизам у ЦСФНЛ7.1 промоторски регион је повезан са одговарајућим изразом. Даљња филогенетска анализа сугерисала је да је ФНЛ7.1 Лоцус врло вероватно да ће бити настао из Индије.
 КТЛ-мапирање у БСА анализи за идентификацију региона кандидата повезаног са дужином врата краставаца |  ЛОД Профили дужине врата краставаца КТЛ идентификовано на ЦхР07 |
КСУ, Кс. И др. "Квантитативна особина главне ефекта Локус ФНЛ7.1 кодира касну ембриогенезу обилне протеине повезане са дужином воћа у краставцу." Часопис Биљне биотехнологије 18.7 (2020).
