Sekuenca e tërë transkriptomit – Illumina
Veçoritë
● Bibliotekë e dyfishtë për të renditur transkriptomën e plotë: zbrazja e rRNA e ndjekur nga përgatitja e bibliotekës PE150 dhe përzgjedhja e madhësisë e ndjekur nga përgatitja e bibliotekës SE50
● Analiza e plotë bioinformatike e mRNA, lncARN, circRNA dhe miRNA në raporte të veçanta bioinformatike
● Analizë e përbashkët e të gjithë shprehjes së ARN-së në një raport të kombinuar, duke përfshirë analizën e rrjeteve ceRNA.
Avantazhet e Shërbimit
●Analiza e thelluar e Rrjeteve Rregullatore: Analiza e rrjetit ceRNA mundësohet nga renditja e përbashkët e mRNA, lncARN, circRNA dhe miRNA dhe nga një rrjedhë pune shteruese bioinformatike.
●Shënim gjithëpërfshirës: Ne përdorim baza të të dhënave të shumta për të shënuar funksionalisht gjenet e shprehura në mënyrë diferenciale (DEG) dhe për të kryer analizën përkatëse të pasurimit, duke ofruar njohuri mbi proceset qelizore dhe molekulare që qëndrojnë në bazë të përgjigjes së transkriptomit.
●Ekspertizë e gjerë: Me një histori të mbylljes me sukses të mbi 2100 projekteve të tëra transkriptome në fusha të ndryshme kërkimore, ekipi ynë sjell një përvojë të pasur për çdo projekt.
●Kontroll rigoroz i cilësisë: Ne zbatojmë pikat kryesore të kontrollit në të gjitha fazat, nga përgatitja e mostrës dhe bibliotekës deri te sekuenca dhe bioinformatika. Ky monitorim i përpiktë siguron dhënien e rezultateve të vazhdueshme me cilësi të lartë.
●Mbështetje pas shitjes: Angazhimi ynë shtrihet përtej përfundimit të projektit me një periudhë shërbimi pas shitjes 3-mujore. Gjatë kësaj kohe, ne ofrojmë ndjekjen e projektit, ndihmë për zgjidhjen e problemeve dhe sesione pyetjesh dhe përgjigjesh për të adresuar çdo pyetje në lidhje me rezultatet
Kërkesat e mostrës dhe dorëzimi
| Biblioteka | Strategjia e renditjes | Të dhënat e rekomanduara | Kontrolli i cilësisë |
| rARN i varfëruar | Ndriçues PE150 | 16 Gb | Q30≥85% |
| Madhësia e zgjedhur | Illumina SE50 | 10-20 milion lexim |
Kërkesat e mostrës:
Nukleotidet:
| Konk.(ng/μl) | Sasia (μg) | Pastërti | Integriteti |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ndotje e kufizuar ose pa proteina ose ADN e treguar në xhel. | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; lartësi bazë e kufizuar ose aspak |
Dorëzimi i mostrës së rekomanduar
Enë: tub centrifuge 2 ml (Folja e kallajit nuk rekomandohet)
Etiketimi i mostrës: Grup+përsëritje p.sh. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Dërgesa:
1. Akull i thatë: Mostrat duhet të paketohen në thasë dhe të varrosen në akull të thatë.
2. Tubat e qëndrueshme ndaj ARN-së: Mostrat e ARN-së mund të thahen në tubin e stabilizimit të ARN-së (p.sh. RNAstable®) dhe të dërgohen në temperaturën e dhomës.
Rrjedha e punës së shërbimit
Dizajni i eksperimentit
Dorëzimi i mostrës
Ekstraktimi i ARN-së
Ndërtimi i bibliotekës
Sekuenca
Analiza e të dhënave
Shërbimet pas shitjes
Bioinformatika
Përmbledhje e shprehjes së ARN-së
Gjene të shprehura në mënyrë diferenciale
analiza ceRNA
MiRNA të shprehura në mënyrë diferenciale dhe ARN të lidhura
Eksploroni përparimet e kërkimit të lehtësuar nga shërbimet e tëra të renditjes së transkriptimeve të BMKGene përmes një koleksioni të kuruar publikimesh.
Dai, Y. et al. (2022) 'Profilet gjithëpërfshirëse të shprehjes së mARN-ve, lncARN-ve dhe miRNA-ve në sëmundjen Kashin-Beck të identifikuar nga sekuenca e ARN-së', Molecular Omics, 18 (2), f. 154-166. doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al. (2022) 'Analiza e transkriptomeve me gjatësi të plotë të rezistencës ndaj të ftohtit të Apis cerana në malin Changbai gjatë periudhës së dimrit.', Gene, 830, fq. 146503-146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) 'Prioritetizimi i bazuar në integrimin multi-omics të rrjeteve konkurruese të rregullimit endogjen të ARN-së në Kancerin e Mushkërive të Qelizës së Vogël: Karakteristikat molekulare dhe Kandidatët e Barnave', Kufijtë në Onkologji, 12, f. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al. (2022) 'Analiza e integruar e profileve të shprehjes lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA zbulon njohuri të reja në mekanizmat e mundshëm në përgjigje të nematodeve të nyjeve të rrënjëve në kikirikë', BMC Genomics, 23(1), fq. 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Z. et al. (2022) 'Sekuenca e ARN-së me transkriptomë të plotë thekson mekanizmat molekularë të lidhur me ruajtjen e cilësisë pas vjeljes në brokoli nga rrezatimi LED i kuq', Biologjia dhe Teknologjia e Postharvest, 188, f. 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
