Sekuenca e ARN-së së vogël-Illumina
Veçoritë
● Përgatitja e bibliotekës përfshin një hap të zgjedhjes së madhësisë
● Analiza bioinformatike e përqendruar rreth parashikimit të miRNA dhe objektivave të tyre
Avantazhet e Shërbimit
●Analizë gjithëpërfshirëse bioinformatike:Mundësimi i identifikimit si të miRNA-ve të njohura ashtu edhe atyre të reja, identifikimi i objektivave të miRNA-ve dhe shënimi funksional përkatës dhe pasurimi me baza të të dhënave të shumta (KEGG, GO)
●Kontroll rigoroz i cilësisë: Ne zbatojmë pikat kryesore të kontrollit në të gjitha fazat, nga përgatitja e mostrës dhe bibliotekës deri te sekuenca dhe bioinformatika. Ky monitorim i përpiktë siguron dhënien e rezultateve të vazhdueshme me cilësi të lartë.
●Mbështetje pas shitjes: Angazhimi ynë shtrihet përtej përfundimit të projektit me një periudhë shërbimi pas shitjes 3-mujore. Gjatë kësaj kohe, ne ofrojmë ndjekjen e projektit, ndihmë për zgjidhjen e problemeve dhe sesione pyetjesh dhe përgjigjesh për të adresuar çdo pyetje në lidhje me rezultatet.
●Ekspertizë e gjerë: Me një histori të mbylljes me sukses të projekteve të shumta sRNA që mbulojnë mbi 300 specie në fusha të ndryshme kërkimore, ekipi ynë sjell një përvojë të pasur në çdo projekt.
Kërkesat e mostrës dhe dorëzimi
| Biblioteka | Platforma | Të dhënat e rekomanduara | QC e të dhënave |
| Madhësia e zgjedhur | Illumina SE50 | 10M-20M lexime | Q30≥85% |
Kërkesat e mostrës:
Nukleotidet:
| Konk.(ng/μl) | Sasia (μg) | Pastërti | Integriteti |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ndotje e kufizuar ose pa proteina ose ADN e treguar në xhel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; lartësi bazë e kufizuar ose aspak |
● Bimët:
Rrënja, kërcelli ose petali: 450 mg
Gjethja ose fara: 300 mg
Fruta: 1.2 g
● Kafsha:
Zemra ose zorrë: 450 mg
Të brendshmet ose truri: 240 mg
Muskujt: 600 mg
Kockat, flokët ose lëkurën: 1,5 g
● Artropodët:
Insektet: 9 g
Krustace: 450 mg
● Gjak i plotë: 2 tuba
● Qelizat: 106 qelizat
● Serumi dhe plazma:6 ml
Dorëzimi i mostrës së rekomanduar
Enë: tub centrifuge 2 ml (Folja e kallajit nuk rekomandohet)
Etiketimi i mostrës: Grup+përsëritje p.sh. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Dërgesa:
1. Akull i thatë: Mostrat duhet të paketohen në thasë dhe të varrosen në akull të thatë.
2. Tubat e qëndrueshëm me ARN: Mostrat e ARN-së mund të thahen në tubin e stabilizimit të ARN-së (p.sh. RNAstable®) dhe të dërgohen në temperaturën e dhomës.
Rrjedha e punës së shërbimit
Dizajni i eksperimentit
Dorëzimi i mostrës
Ekstraktimi i ARN-së
Ndërtimi i bibliotekës
Sekuenca
Analiza e të dhënave
Shërbimet pas shitjes
Bioinformatika
● Kontrolli i cilësisë së të dhënave të papërpunuara
● Klasifikimi i sRNA
● Përafrimi me një gjenom referues
● Identifikimi i ARN-së së njohur dhe të re
● Analiza diferenciale e shprehjes së miRNA
● Shënimi funksional i objektivave të miRNA
Identifikimi i miRNA: struktura dhe thellësia
Shprehja diferenciale e miRNA – grupimi hiearkik
Shënimi funksional i objektivit të miRNA-ve të shprehura në mënyrë diferenciale
Eksploroni përparimet e kërkimit të lehtësuar nga shërbimet e renditjes së sRNA të BMKGene përmes një koleksioni të kuruar publikimesh.
Chen, H. et al. (2023) 'Infeksionet virale pengojnë biosintezën dhe fotosintezën e saponinave në Panax notoginseng', Fiziologjia dhe Biokimia e Bimëve, 203, f. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Proteina FREE1 që përmban domenin e bimës FYVE lidhet me komponentët e mikroprocesorit për të shtypur biogjenezën e miRNA', raporton EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p kontrollon zhvillimin e pupës së larvave duke synuar domenet e shumëfishta të faktorëve të rritjes së epidermës 8 (megf8) në bletën e mjaltit, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), f. . 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Analiza e integruar e MiRNA dhe gjeneve të lidhura me cilësinë e mishit zbulon se Gga-MiR-140-5p ndikon në depozitimin e yndyrës intramuskulare te pulat', Fiziologjia dhe Biokimia Qelizore, 46(6), f. 2421-2433. doi: 10.1159/000489649.
