Reduktimi i sekuencave të bisulfitit të përfaqësimit (RRBS)
Reduktimi i sekuencave të bisulfitit të përfaqësimit (RRBS) është shfaqur si një alternative me kosto efektive dhe efikase për sekuencat e bisulfitit të gjenomit të tërë (WGBS) në hulumtimin e metilimit të ADN-së. Ndërsa WGBS siguron një pasqyrë gjithëpërfshirëse duke ekzaminuar të gjithë gjenomin në rezolucion të vetëm bazë, kostoja e tij e lartë mund të jetë një faktor kufizues. RRBS zbut në mënyrë strategjike këtë sfidë duke analizuar në mënyrë selektive një pjesë përfaqësuese të gjenomit. Kjo metodologji mbështetet në pasurimin e rajoneve të pasura me ishull CpG nga ndarja e MSPI e ndjekur nga zgjedhja e madhësisë së fragmenteve 200-500/600 bps. Si pasojë, vetëm rajonet proksimale me ishujt CpG renditen, ndërsa ato me ishuj të largët CpG janë të përjashtuar nga analiza. Ky proces, i kombinuar me sekuencat e bisulfitit, lejon zbulimin me rezolucion të lartë të metilimit të ADN-së, dhe qasja e sekuencave, PE150, përqendrohet posaçërisht në skajet e futjeve sesa në mes, duke rritur efikasitetin e profilizimit të metilimit. RRBS është një mjet i paçmueshëm që mundëson hulumtimin me kosto efektive të metilimit të ADN-së dhe përparon njohjen e mekanizmave epigjenetikë.
Karakteristikat e shërbimit
● Kërkon një gjenom referimi.
● ADN lambda përdoret për të monitoruar efikasitetin e konvertimit bisulfite.
Monitorohet gjithashtu efikasiteti i tretjes së MSPI.
● Tretja e dyfishtë e enzimës për mostrat e bimëve.
● Sekuencimi në Illumina Novaseq.
Avantazhet e shërbimit
>Alternative me kosto efektive dhe efikase për WGBS: Mundësimi i analizës të bëhet me një kosto më të ulët dhe me kërkesa më të ulëta të mostrës.
>Platforma e plotë:Siguroni një shërbim të shkëlqyeshëm nga përpunimi i mostrave, ndërtimi i bibliotekës dhe renditja në analizën e bioinformatikës.
>Ekspertizë e gjerë: Me projektet e sekuencave të RRBS të përfunduara me sukses në një gamë të larmishme të specieve, BMKGene sjell mbi një dekadë përvojë, një ekip analize shumë të aftë, përmbajtje gjithëpërfshirëse dhe mbështetje të shkëlqyeshme pas shitjes.
Specifikimet e shërbimit
| Bibliotekë | Strategjia e sekuencave | Prodhimi i rekomanduar i të dhënave | Kontroll i cilësisë |
| Biblioteka e Trajtuar e MSPI Digested dhe Bisulfite | Illumina PE150 | 8 GB | Q30 ≥ 85% Konvertimi Bisulfite> 99% Efikasiteti i prerjes së MSPI> 95% |
Kërkesat e mostrës
| Përqendrimi (ng/μl) | Shuma totale (μg) |
| |
| ADN gjenomike | ≥ 30 | ≥ 1 | Degradim ose ndotje e kufizuar |
Rrjedha e punës së shërbimit
Dorëzimi i mostrës
Ndërtim bibliotekash
Sekuencim
Analiza e të dhënave
Shërbime pas shitjes
Përfshinë analizën e mëposhtme:
Control Kontrolli i cilësisë së sekuencave të papërpunuara;
● Hartimi për të referuar gjenomin;
● Zbulimi i bazave të metilizuara 5mc dhe identifikimi i motivit;
● Analiza e shpërndarjes së metilimit dhe krahasimi i mostrës;
● Analiza e rajoneve të metilizuara në mënyrë të ndryshme (DMR);
● Annotimi funksional i gjeneve të lidhura me DMR.
Kontrolli i Cilësisë: Efikasiteti i tretjes (në hartografimin e gjenomit)
Kontrolli i Cilësisë: Konvertimi Bisulfite (në nxjerrjen e informacionit të metilimit)
Harta e metilimit: Shpërndarja e gjenomit të metilimit 5mc të gjerë
Krahasimi i mostrës: Analiza kryesore e komponentit
Analiza e rajoneve të metilizuara në mënyrë të ndryshme (DMRS): Harta e nxehtësisë
Eksploroni përparimet e hulumtimit të lehtësuara nga shërbimet e të gjithëve të sekuencave të gjenomit Bisulfite të BMKGene përmes një koleksioni të kuruar të botimeve.
Li, Z. et al. (2022) 'Riprogramimi i besueshmërisë së lartë në qelizat e ngjashme me leydig nga aktivizimi CRISPR dhe faktorët paracrine',,Pnas nexus, 1 (4). doi: 10.1093/pnasnexus/pgac179.
Tian, H. et al. (2023) 'Analiza e metilimit të ADN-së në gjerësi të gjenomit të përbërjes së trupit në binjakët monozigotikë kinezë',Revista Evropiane e Hetimit Klinik, 53 (11), f. E14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
Wu, Y. et al. (2022) 'metilimi i ADN-së dhe raporti i belit-hip: një studim i shoqatës së gjerë epigjene në binjakët monozigotikë kinezë',Gazeta e Hetimit Endokrinologjik, 45 (12), fq 2365–2376. doi: 10.1007/s40618-022-01878-4.
