Sekuencat e ARN -së prokariotike
Tiparet
Processimi i mostrës së ARN -së përfshin varfërimin e rRNA të ndjekur nga përgatitja e bibliotekës së ARN -së së drejtuar.
Analysis Analiza bioinformatike bazuar në përafrimin me një gjenom referimi
● Analiza përfshin shprehjen e gjenit dhe DEG, por edhe strukturën e transkriptit dhe analizën e sRNA
Avantazhet e shërbimit
>Kontroll rigoroz i cilësisë: Ne zbatojmë pikat kryesore të kontrollit në të gjitha fazat, nga përgatitja e mostrës dhe bibliotekës deri tek sekuencat dhe bioinformatika. Ky monitorim i përpiktë siguron shpërndarjen e rezultateve me cilësi të lartë vazhdimisht.
>Të dhëna për sekuencat specifike të fijes: Për shkak të përgatitjes së bibliotekës së ARN-së duke qenë e drejtuar, duke mundësuar identifikimin e transkriptimeve kundër sensit.
>Analizë e plotë e përshtatur me transkriptomet prokariotike: Tubacioni bioinformatik përfshin jo vetëm analizën e shprehjes së gjenit, por edhe analizën e strukturës së transkriptit, duke përfshirë identifikimin e operoneve, UTR dhe promovuesve. Ai gjithashtu përfshin analizën e srnas, përkatësisht shënimin dhe parashikimin e strukturës dytësore dhe objektivave.
>Mbështetje pas shitjes: Angazhimi ynë shtrihet përtej përfundimit të projektit me një periudhë shërbimi pas shitjes 3-mujore. Gjatë kësaj kohe, ne ofrojmë ndjekjen e projektit, ndihmën e zgjidhjes së problemeve dhe seancat e Q&A për të adresuar çdo pyetje që lidhen me rezultatet.
Kërkesat e mostrës dhe shpërndarja
| Bibliotekë | Strategjia e sekuencave | Të dhënat e rekomanduara | Kontroll i cilësisë |
| rRNA biblioteka e drejtuar nga drejtimi | Illumina PE150 | 1-2 GB | Q30≥85% |
Kërkesat e mostrës:
| Konk. (Ng/μl) | Shuma (μg) | Pastërti | Integritet |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260/280 = 1.8-2.0 OD260/230 = 1.0-2.5 Ndotje e kufizuar ose pa proteina ose ADN e treguar në xhel. | Rin≥6.5 |
Dorëzimi i rekomanduar i mostrës
Enë: 2 ml tub centrifugë (fletë kallaji nuk rekomandohet)
Etiketimi i mostrës: Grupi+Replikoni EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Dërgesa:
1. ICE-ICE: Mostrat duhet të paketohen në çanta dhe të varrosen në akull të thatë.
2. Tuba të RNASTABLE: Mostrat e ARN -së mund të thahen në tubin e stabilizimit të ARN (p.sh. RNASTABLE®) dhe të dërgohen në temperaturën e dhomës.
Rrjedha e punës së shërbimit
Dorëzimi i mostrës
Ndërtim bibliotekash
Sekuencim
Analiza e të dhënave
Shërbime pas shitjes
Analiza bioinformatike e rrjedhës së punës
Përfshinë analizën e mëposhtme:
Control Kontrolli i cilësisë së të dhënave të papërpunuara
● Rreshtimi me gjenomin e referencës
Vlerësimi i cilësisë së bibliotekës: Rastësia e fragmentimit të ARN -së, futni madhësinë dhe ngopjen e sekuencave
● Annotimi funksional i gjeneve të parashikuara të kodimit
Analysis Analiza e shprehjes: Korrelacioni dhe Analiza e Komponentit Kryesor (PCA)
Expression Expression i gjenit diferencial (DEG)
Annotim Annotimi dhe pasurimi i DEG -ve
Analysis Analiza e SRNA: Parashikimi, shënimi, objektivi dhe parashikimi i strukturës sekondare
Analysis Analiza e strukturës së transkriptit: Operonet, pozicionet e fillimit dhe mbarimit, rajoni i pakontrolluar (UTS), nxitësi dhe analiza SNP/Indel
Sekuencimi i ngopjes
Shënimi funksional i gjeneve të kodimit
Korrelacioni midis mostrave
Analiza e gjeneve të shprehura diferenciale (DEG)
Analiza funksionale e pasurimit
shënim sRNA
Eksploroni përparimet e lehtësuara nga shërbimet e sekuencave të mRNA me gjatësi të plotë të BMKGene në këtë botim të paraqitur.
Guan, CP et al. (2018) 'Ndryshimet transkriptome globale të formulimit të biofilmës Staphylococcus epidermidis duke iu përgjigjur alkaloideve totale të soforea alopecuroides',Revista Polake e Mikrobiologjisë, 67 (2), f. 223. doi: 10.21307/PJM-2018-024.
