Hartë e nxehtësisë
Mjeti HeatMap pranon një skedar të të dhënave të matricës si input dhe lejon përdoruesit të filtrojnë, normalizojnë dhe grumbullojnë të dhënat. Rasti i përdorimit parësor për hartat e nxehtësisë është analiza e grupeve të nivelit të shprehjes së gjenit midis mostrave të ndryshme.
Shënim gjenesh
Mjeti i Annotimit të Gjeneve kryen shënimin e gjeneve bazuar në shtrirjen e sekuencave të skedarëve të hyrjes FASTA kundër bazave të të dhënave të ndryshme.
Mjeti themelor i kërkimit të shtrirjes lokale (BLAST)
Mjeti BLAST është një version i integruar BMKCLOUD i NCBI BLAST dhe mund të përdoret për të kryer të njëjtat funksione duke përdorur të dhëna të ngarkuara në llogarinë BMKCLOUD.
Parashikimi CDS_UTR
Mjeti i parashikimit CDS_UTR është krijuar për të parashikuar rajone të kodimit (CDS) dhe rajone jo-koduese (UTR) në sekuencat e dhëna të transkriptimit bazuar në rezultatet e shpërthimit kundër bazave të të dhënave të njohura të proteinave dhe rezultateve të parashikimit të ORF.
Manhattan komplot
Mjeti i komplotit Manhattan mundëson shfaqjen e eksperimenteve të mostrave të larta dhe përdoret zakonisht në studimet e shoqatës së gjerë të gjenomit (GWAS).
Diagramë cirku
Mjeti i diagramit Circs siguron vizualizim efikas se si shpërndahen tipari gjenomik në të gjithë gjenomin. Karakteristikat e zakonshme përfshijnë lokacione sasiore, SNP, indels, variante strukturore dhe të numrave të kopjeve.
Pasurimi i Ontologjisë së Gjenit (GO)
Mjeti i pasurimit GO siguron analizën funksionale të pasurimit. Softueri kryesor në këtë mjet është paketa topgo-bioconductor, e cila përfshin analizën e shprehjes diferenciale, analizën e pasurimit të GO dhe vizualizimin e rezultateve.
Analiza e Rrjetit të Bashkë-Shprehjes së Gjenit të Peshuar (WGCNA)
WGCNA është një metodë e përdorur gjerësisht e minierave të të dhënave për zbulimin e moduleve të bashkë-shprehjes së gjeneve. Isshtë e zbatueshme për të dhënat e ndryshme të shprehjes, duke përfshirë të dhënat e shprehjes së gjenit Microarray dhe NGS.
Ndërveprues
Mjeti Interproscan siguron analizën dhe klasifikimin e sekuencës së proteinave interpro.
Shko pasurimin e KEGG
Mjeti i pasurimit GO KEGG është dizajn për të gjeneruar një histogram të pasurimit të Go, histogram të pasurimit të KEGG dhe rrugën e pasurimit të KEGG bazuar në një grup gjenesh të dhënë dhe shënim përkatës.