Pacbio Transkriptom me gjatësi të plotë

Sekuencimi transkriptom me gjatësi të plotë PacBio, ISOSEQ, mundëson identifikimin e saktë të izoformave të transkriptit, duke derdhur dritë mbi poladenilimin dhe shkrirjen alternative, dhe duke çuar në një analizë më të saktë të shprehjes së gjenit. Tubacioni transkriptom me gjatësi të plotë BMKCLOUD PACBIO është krijuar për të analizuar bibliotekat e cDNA të sekuencuara në modalitetin e sekuencave të konsensusit rrethor (CCS) dhe identifikon sekuencat jo-kimerike me gjatësi të plotë (FLNC), të cilat më pas janë grumbulluar në transkriptime jo të rrepta. Një analizë e mëvonshme BUSCO vlerëson tërësinë e asamblesë transkriptome. Nga transkriptomi i mbledhur, kryhen analiza të shumta: shkrirja alternative, përsëritja e sekuencës së thjeshtë (SSR), parashikimi i lncRNA dhe gjenet përkatëse të synuara, parashikimi i gjeneve të reja, analiza e familjes së gjenit, analiza e faktorëve të transkriptimit dhe shënimi funksional i transkriptimeve.