mRNA-seq (NGS) me gjenomin referues
ARN-seq është një mjet standard në të gjithë shkencat e jetës dhe të bimëve, duke kapërcyer hendekun midis gjenomave dhe proteomeve. Forca e tij qëndron në zbulimin e transkripteve të reja dhe përcaktimin sasior të shprehjes së tyre në një analizë. Përdoret gjerësisht për studime krahasuese transkriptomike, duke hedhur dritë mbi gjenet që lidhen me tipare ose fenotipe të ndryshme, si krahasimi i mutantëve me llojet e egra ose zbulimi i shprehjes së gjeneve në kushte specifike. BMKCloud mRNA (Referenca) APP integron kuantifikimin e shprehjes, analizën e shprehjes diferenciale (DEG) dhe analizat e strukturës së sekuencës në tubacionin e bioinformatikës mRNA-seq (NGS) dhe bashkon pikat e forta të softuerit të ngjashëm, duke siguruar komoditet dhe lehtësi për përdoruesit. Përdoruesit mund të ngarkojnë të dhënat e tyre ARN-seq në cloud, ku Aplikacioni ofron një zgjidhje gjithëpërfshirëse të analizës bioinformatike me një ndalesë. Për më tepër, ai i jep përparësi përvojës së klientit, duke ofruar operacione të personalizuara të përshtatura për nevojat specifike të përdoruesve. Përdoruesit mund të vendosin parametra dhe të paraqesin vetë misionin e tubacionit, të kontrollojnë raportin interaktiv, të shikojnë të dhënat/diagramet dhe të plotësojnë minierat e të dhënave, si: përzgjedhja e gjeneve të synuara, grupimi funksional, diagramimi, etj.
Platforma:Illumina, MGI
Strategjia:ARN-Seq
Paraqitja: Të ndara, të pastra.
Lloji i bibliotekës:fr-pavarguar, fr-fillesa e parë ose fr-fillesa e dytë
Gjatësia e leximit:150 bp
Lloji i skedarit:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz ose *.fq.gz. Sistemi doçiftoni automatikisht skedarët .fastq sipas emrave të skedarëve të tyre,p.sh. *_1.fastq çiftuar me *._2.fastq.
Numri i mostrave:Nuk ka kufizime për numrintë mostrave, por koha e analizës do të rritet me numrin emostrat rriten.
Sasia e rekomanduar e të dhënave:6G për mostër