Sekuenca e transkriptomeve me gjatësi të plotë bazuar në nanopore
Sekuenca e nanoporeve dallohet nga platformat e tjera të sekuencës, në atë që nukleotidet lexohen drejtpërdrejt pa sintezë të ADN-së dhe gjenerojnë lexime të gjata në dhjetëra kilobazë. Kjo fuqizon leximin e drejtpërdrejtë të transkripteve të plota dhe trajtimin e sfidave në studimet transkriptomike.
√ Paragjykim i ulët i sekuencës specifike
√ Leximi i plotë i cDNA për studime të strukturës së gjeneve
√ Kërkohen më pak të dhëna për të mbuluar të njëjtin numër transkriptesh
√ Identifikimi i izoformave të shumta për gjen
√ Kuantifikimi i shprehjes në nivelin e izoformës
Tubacioni tipik i Bioinformatikës
Rastet më të fundit të suksesshme me Biomarker Technologies
1. Analizat krahasuese të transkriptomeve me gjatësi të plotë zbulojnë dinamikën e zhvillimit të kërcellit Gnetum luofuense
Revista: Kufijtë në Gjenetikë
Publikuar: Mars 2021
Fjalë kyçe: MinION | Ndarja alternative | APA | lncARN | Transkriptet e shprehura në mënyrë diferenciale
Lexoni tekstin e plotë
2. Lëvizja e njëanshme e ARN-ve të vogla nga lastarët tek rrënjët në heterograftet ndërspecifike
Revista: Bimët e natyrës
Publikuar: Janar 2021
Fjalë kyçe: Nanopore | Illumina | zbulimi i mARN-së celulare me gjatësi të plotë
3. Analiza transkriptome e plotë e rrënjëve të shpargut zbulon mekanizmin molekular të tolerancës ndaj kripës të shkaktuar nga kërpudhat mikorizale arbuskulare
Revista: Botanikë Mjedisore dhe Eksperimentale
Publikuar: Janar 2021
Fjalë kyçe: MinION | Transkriptet e shprehura në mënyrë diferenciale | Faktorët e transkriptimit | Ndarja alternative
4. Ndryshimet karakteristike fiziologjike dhe transkriptimi i plotë i rrënjëve dhe gjetheve të trëndafilit (Rosa chinensis) në përgjigje të stresit të thatësirës
Revista: Fiziologjia e bimëve dhe qelizave
Publikuar: Tetor 2020
Fjalë kyçe: PromethION | Transkriptet e shprehura në mënyrë diferenciale | Parashikimi funksional | Izoformat e bashkuara | TF dhe lncARN
5. Analiza dhe krahasimi gjithëpërfshirës i sekuencës së ARN-së me bazë PacBio dhe nanopore të transkriptomës Arabidopsis
Ditari: Metoda e bimëve
Publikuar: Prill 2020
Fjalë kyçe: GridION | PromethION | Vazhdimi i PacBio | Illumina NovaSeq | Rreshtimi i gjenomit | Identifikimi i transkriptit | Ndarja alternative | SSR | LncARN | Kuantifikimi i izoformës
Lajme dhe pika kryesore synon të ndajë rastet më të fundit të suksesshme me Biomarker Technologies, duke kapur arritjet e reja shkencore si dhe teknikat e spikatura të aplikuara gjatë studimit.
Koha e postimit: Jan-08-2022