Transkriptom me gjatësi të plotë nanopore

Sekuencimi transkriptom nanopore është një metodë e fuqishme për sekuencat e cDNA me gjatësi të plotë, duke identifikuar me saktësi dhe kuantifikimin e izoformave të transkriptit. Tubacioni transkriptom me gjatësi të plotë BMKCLOUD Nanopore është krijuar për të analizuar të dhënat e ARN-seq të krijuara në platformën nanopore kundër një gjenomi referimi me cilësi të lartë, të referencës, duke siguruar analiza cilësore dhe sasiore në nivelin e gjenit dhe transkriptit. Pas kontrollit të cilësisë, sekuencat jo-kimerike (FLNC) me gjatësi të plotë janë marrë dhe sekuencat e konsensusit janë regjistruar në gjenomin e referencës për të hequr transkriptet e tepërta. Nga ky grup transkriptimi, shprehja është kuantifikuar dhe gjenet dhe transkriptet e shprehura në mënyrë të ndryshme janë identifikuar dhe shënuar funksionalisht. Tubacioni gjithashtu përfshin analizën alternative të poladenilimit (APA), analizën alternative të shkrirjes, analizën e përsëritjes së sekuencës së thjeshtë (SSR), parashikimin e lncRNA dhe objektivat përkatëse, parashikimin e sekuencave të kodimit (CDS), analizën e familjes së gjenit, analizën e faktorit të transkriptimit, parashikimin e gjeneve të reja dhe shënimi funksional i transkriptimeve.