mRNA-seq (NGS) – De novo

Sekuenca e mRNA lejon profilizimin e të gjitha transkripteve të mRNA në qeliza në kushte specifike dhe është një teknologji e përdorur gjerësisht në fusha të ndryshme kërkimore. Tubacioni BMKCloud De novo mRNA-seq është krijuar për të analizuar bibliotekat e sekuencave të pasuruara me poli-A kur nuk disponohet gjenomi referencë. Tubacioni fillon me kontrollin e cilësisë, i ndjekur ngade novomontimi i transkriptit dhe përzgjedhja e grupit unigene. Analiza e strukturës unigjene parashikon sekuencën koduese (CDS) dhe përsëritjen e sekuencës së thjeshtë (SSR). Më pas, analiza e shprehjes diferenciale gjen gjene të shprehura në mënyrë diferenciale (DEG) midis kushteve të testuara, të ndjekura nga shënimi funksional dhe pasurimi i DEG-ve për të nxjerrë njohuri biologjike.