Exclusive Agency for Korea

条形 banner-03

Produktet

Sekuenca e Eksomës së Tërësisë Njerëzore

Sekuenca e ekzomeve të të gjithë njerëzve (hWES) njihet gjerësisht si një qasje e efektshme dhe e fuqishme e sekuencave për përcaktimin e saktë të mutacioneve që shkaktojnë sëmundje. Pavarësisht se përbëjnë vetëm rreth 1.7% të të gjithë gjenomit, ekzonet luajnë një rol vendimtar duke pasqyruar drejtpërdrejt profilin e funksioneve totale të proteinave. Veçanërisht, në gjenomën e njeriut, mbi 85% e mutacioneve që lidhen me sëmundjet manifestohen brenda rajoneve koduese të proteinave. BMKGENE ofron një shërbim gjithëpërfshirës dhe fleksibël të sekuencës së të gjithë ekzomeve njerëzore me dy strategji të ndryshme të kapjes së ekzoneve të disponueshme për të përmbushur qëllime të ndryshme kërkimore.


Detajet e Shërbimit

Rezultatet e demonstrimit

Karakteristikat e shërbimit

● Dy panele ekzome të disponueshme bazuar në pasurimin e objektivit me sonda: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) dhe xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Sekuenca në Illumina NovaSeq.

● Tubacioni bioinformatik i drejtuar drejt analizës së sëmundjes ose analizës së tumorit.

Avantazhet e Shërbimit

Synon rajonin e kodimit të proteinave: Duke kapur dhe renditur rajonet koduese të proteinave, hWES përdoret për të zbuluar variante që lidhen me strukturën e proteinave.

Me kosto efektive:hWES jep afërsisht 85% të mutacioneve të lidhura me sëmundjet njerëzore nga 1% e gjenomit njerëzor.

Saktësi e lartë: Me thellësi të lartë të renditjes, hWES lehtëson zbulimin e varianteve të zakonshme dhe varianteve të rralla me frekuenca më të ulëta se 1%.

Kontroll rigoroz i cilësisë: Ne zbatojmë pesë pika kryesore të kontrollit në të gjitha fazat, nga përgatitja e mostrës dhe bibliotekës deri te sekuenca dhe bioinformatika. Ky monitorim i përpiktë siguron dhënien e rezultateve të vazhdueshme me cilësi të lartë.

Analizë Gjithëpërfshirëse Bioinformatike: tubacioni ynë shkon përtej identifikimit të variacioneve në gjenomën e referencës, pasi ai përfshin analiza të avancuara të krijuara për të adresuar në mënyrë specifike pyetjet kërkimore që lidhen me aspektet gjenetike të sëmundjeve ose analizën e tumorit.

Mbështetje pas shitjes:Angazhimi ynë shtrihet përtej përfundimit të projektit me një periudhë shërbimi pas shitjes 3-mujore. Gjatë kësaj kohe, ne ofrojmë ndjekjen e projektit, ndihmë për zgjidhjen e problemeve dhe sesione pyetjesh dhe përgjigjesh për të adresuar çdo pyetje në lidhje me rezultatet.

Specifikimet e mostrës

Strategjia e kapjes së Exon

Strategjia e renditjes

Prodhimi i rekomanduar i të dhënave

Sure Select Human All Exon v6 (Agilent)

ose Paneli i Hibridizimit të XGen Exome v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5-10 Gb

Për çrregullimet mendeliane/sëmundjet e rralla: > 50x

Për mostrat e tumorit: ≥ 100x

Kërkesat e mostrës

Lloji i mostrës

 

 Shuma(Qubit®)

 

Përqendrimi 

Vëllimi

 

 

 Pastërti (NanoDrop™)

 

ADN gjenomike

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/μL
≥ 15 μL
 
OD260/280=1,8-2,0
 
pa degradim, pa kontaminim

 

Bioinformatika

Rrjedha e punës WES_BI_Sëmundja-01

Analiza bioinformatike e mostrave të sëmundjes hWES përfshin:

● Renditja e të dhënave QC

● Përafrimi i gjenomit të referencës

● Identifikimi i SNP dhe InDels

● Shënimi funksional i SNP dhe InDels

Rrjedha e punës WES_BI_Tumor-01

Analiza bioinformatike e mostrave të tumorit përfshin:

● Renditja e të dhënave QC

● Përafrimi i gjenomit të referencës

● Identifikimi i SNP-ve, InDels dhe variacioneve somatike

● Identifikimi i varianteve të brezit

● Analiza e nënshkrimeve të mutacioneve

● Identifikimi i gjeneve shtytëse bazuar në mutacionet e fitimit të funksionit

● Shënimi i mutacionit në nivelin e ndjeshmërisë ndaj drogës

● Analiza e heterogjenitetit – llogaritja e pastërtisë dhe ploidisë

Rrjedha e punës së shërbimit

dorëzimi i mostrës

Dorëzimi i mostrës

Eksperiment pilot

Ekstraktimi i ADN-së

Përgatitja e Bibliotekës

Ndërtimi i bibliotekës

Sekuenca

Sekuenca

Analiza e të dhënave

Analiza e të dhënave

数据上传-01

Dorëzimi i të dhënave

Shërbimet pas shitjes

Shërbimet pas shitjes


  • E mëparshme:
  • Tjetër:

  • QC e të dhënave - Statistikat e kapjes së Exome

     

    wps_doc_22

     

    Identifikimi i variantit – InDels

    图片36

    Analiza e avancuar: identifikimi dhe shpërndarja e SNP-ve/InDels të dëmshme – Komploti i Circos

     

    图片37

    Analiza e tumorit: identifikimi dhe shpërndarja e mutacioneve somatike – Grafiku i Circos

     

    图片38

     

    Analiza e tumorit: linjat klonale

     

    图片39

     

    merrni një kuotë

    Shkruani mesazhin tuaj këtu dhe na dërgoni

    Na dërgoni mesazhin tuaj: