Analiza e Shoqatës së Gjenomit
Rrjedha e punës
Avantazhet e Shërbimit
●Ekspertizë e gjerë dhe të dhëna botimesh: me përvojën e akumuluar në GWAS, BMKGene ka përfunduar qindra projekte të specieve në kërkimin e popullatës GWAS, ka ndihmuar studiuesit të publikojnë më shumë se 100 artikuj dhe faktori i ndikimit kumulativ ka arritur në 500.
● Analizë gjithëpërfshirëse bioinformatike: rrjedha e punës përfshin analizën e lidhjes së tipareve SNP, duke ofruar një grup gjenesh kandidate dhe shënimet funksionale përkatëse të tyre.
●Ekipi shumë i aftë i bioinformatikës dhe cikël i shkurtër analizash: me përvojë të madhe në analizën e avancuar të gjenomikës, ekipi i BMKGene ofron analiza gjithëpërfshirëse me një kohë të shpejtë kthimi.
●Mbështetje pas shitjes:Angazhimi ynë shtrihet përtej përfundimit të projektit me një periudhë shërbimi pas shitjes 3-mujore. Gjatë kësaj kohe, ne ofrojmë ndjekjen e projektit, ndihmë për zgjidhjen e problemeve dhe sesione pyetjesh dhe përgjigjesh për të adresuar çdo pyetje në lidhje me rezultatet.
Specifikimet dhe kërkesat e shërbimit
| Lloji i renditjes | Shkalla e rekomanduar e popullsisë | Strategjia e renditjes | Kërkesat për nukleotide |
| Sekuenca e të gjithë gjenomit | 200 mostra | 10x | Përqendrimi: ≥ 1 ng/µL Sasia totale≥ 30 ng Degradim ose kontaminim i kufizuar ose aspak |
| Fragment i përforcuar me vend specifik (SLAF) | Thellësia e etiketës: 10x Numri i etiketave: < 400 Mb: rekomandohet WGS < 1 Gb: 100 mijë etiketa 1 Gb > 2 Gb: 300 mijë etiketa Maksimumi 500 mijë etiketa | Përqendrimi ≥ 5 ng/µL Sasia totale ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1,6-2,5 Xhel agarozë: pa degradim ose kontaminim i kufizuar ose i kufizuar
|
Përzgjedhja e materialit
Varietetet e ndryshme, nënllojet, racat tokësore/bankat e gjeneve/familjet e përziera/burimet e egra
Varietete të ndryshme, nënspecie, raca vendase
Familje gjysmake/familje plot sib/burime të egra
Rrjedha e punës së shërbimit
Dizajni i eksperimentit
Dorëzimi i mostrës
Ekstraktimi i ARN-së
Ndërtimi i bibliotekës
Sekuenca
Analiza e të dhënave
Shërbimet pas shitjes
Përfshin analizën e mëposhtme:
- Analiza e lidhjes në të gjithë gjenomin: modeli LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- Shënimi funksional i gjeneve kandidate
Analiza e shoqërimit të tipareve SNP - Komploti i Manhatanit
Analiza e shoqërimit të tipareve SNP – komploti QQ
Eksploroni përparimet e lehtësuara nga shërbimet de GWAS të BMKGene përmes një koleksioni të kuruar publikimesh:
Lv, L. et al. (2023) "Pamje mbi bazën gjenetike të tolerancës së amoniakut në molusqet e briskut Sinonovacula constricta nga studimi i shoqatës së gjenomit",Akuakultura, 569, f. 739351. doi: 10.1016/J.AKUAKULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Analizat multi-omike të 398 shtesave të melit të bishtit të dhelprës zbulojnë rajone gjenomike të lidhura me zbutjen, tiparet e metabolitit dhe efektet anti-inflamatore',Bimë molekulare, 15 (8), f. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Hartë e shoqatës së gjenomit të fenotipeve me zor të zhveshur në mjedisin e thatësirës',Kufijtë në shkencën e bimëve, 13, f. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'GmST1, e cila kodon një sulfotransferazë, jep rezistencë ndaj shtameve të virusit të mozaikut të sojës G2 dhe G3',Bimët, Qelizat dhe Mjedisi, 44 (8), f. 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
