Analiza e MRNA eukariote (Opsionet e bazuara në referencë dhe de novo në dispozicion)
Ky tubacion përdor të dhëna NGS ARN-seq si input dhe prodhon rezultate nga analiza të shumta në rrjedhën e poshtme, duke përfshirë por jo të kufizuar në: Sekuencimin e Vlerësimit të Cilësisë së të Dhënave,de novoAnnotimi i sitit të transkriptimit, analiza e shkrirjes së ndryshueshme, analiza e shprehjes diferenciale, shënimi i funksionit dhe analiza e pasurimit.
Analizë e gjatë e ARN-së jo-koduese
ARN të gjata jo-koduese (lncRNA) janë transkriptime jo-koduese me gjatësi më të gjatë se 200 nt dhe dihet se luajnë role në organizimin dhe rregulloren e kromatinës. Teknologjitë e sekuencave të larta të sekuencave dhe bioinformatike kanë fuqizuar sekuencat tona të të kuptuarit të lncRNA dhe informacionin e pozicionimit për të identifikuar lncRNA me funksione rregullatore thelbësore. Ky tubacion siguron analiza lncRNA përveç analizave të përmendura në tubacionin eukariotik të analizës së mRNA.
16S/18S/Sekuencimi i tij i ampliconit
Tubacioni i analizës së diversitetit mikrobik të sekuencave të ampliconit u zhvillua bazuar në përvojën e viteve në analizën e projektit të diversitetit mikrobik. Tubacioni përmban një analizë themelore të standardizuar, e cila përfshin përmbajtjen e analizës kryesore të hulumtimit aktual mikrobik dhe analizës së personalizuar. Raporti i analizës është i pasur dhe gjithëpërfshirës, me mundësinë për të kryer analiza të larmishme personale. Për më tepër, mostrat dhe grupet mund të modifikohen në fluturim për personalizim dhe kontroll shtesë.
Analiza e metagjenomikës me armë gjahu
Tubacioni i analizës metagjenomike të shotgunit përdor të dhëna NGS nga materiale gjenomike të përziera të nxjerra nga mostrat e mjedisit. Analizat e përfshira ofrojnë informacione të hollësishme mbi diversitetin dhe bollëkun e specieve, strukturën e popullsisë, marrëdhëniet filogjenetike, gjenet funksionale dhe rrjetet e korrelacionit me faktorët mjedisorë.
NGS-WGS Analiza e Variantit
Analiza e variantit NGS-WGS është një tubacion i integruar i zbulimit të varianteve që kryen kontrollin e cilësisë së të dhënave, shtrirjen e sekuencës, shënimin dhe analizën e mutacionit të gjeneve. Tubacioni ndjek praktikat më të mira të GATK për zbulimin e SNP dhe indel dhe përdor Manta për thirrjen strukturore të varianteve.
Studimi i Shoqatës së Gjenomit të gjerë (GWAS)
Tubacioni GWAS është një analizë në rrjedhën e poshtme që merr skedarë VCF të gjeneruar më parë dhe të dhëna përkatëse të fenotipit për një grup individësh si të dhëna. Duke përdorur metodologji specifike statistikore, GWAS synon të zbulojë variacionet e nukleotideve në të gjithë gjenomin, të lidhura me ndryshimet fenotipike. Ajo luan një rol vendimtar në eksplorimin e gjeneve funksionale të lidhura me sëmundje komplekse njerëzore dhe tipare të ndërlikuara në bimë dhe kafshë.
Analiza e ndarjes me shumicë (BSA)
Analiza e BSA përfshin bashkimin e individëve me tipare ekstreme fenotipike nga një popullatë e ndarë. Duke krahasuar vendndodhjet diferenciale midis mostrave të grumbulluara, kjo qasje identifikon me shpejtësi shënuesit molekularë të lidhur ngushtë të lidhur me gjenet e synuara. E përdorur gjerësisht në hartografimin gjenetik të bimëve dhe kafshëve, është një mjet i vlefshëm për mbarështimin e ndihmuar nga shënuesit.
Analiza e gjenetikës evolucionare
Analiza e evolucionare e gjenetikës së rrjedhës së punës lejon përvojën e gjerë të BMKGene në projektet e evolucionit gjenetik dhe përfshin ndërtimin e pemëve filogjenetike, analizën e disekuilibrit të lidhjes, vlerësimin e diversitetit gjenetik, identifikimin selektiv të spastrimit, analizën e farefisit, analizën kryesore të komponentëve dhe karakterizimin e strukturës së popullsisë.
