Sekuenca e ARN-së eukariote-NGS
Veçoritë
● Kapja e poli mRNA para përgatitjes së bibliotekës
● Përgatitja opsionale e bibliotekës së mRNA me drejtim për të mundësuar marrjen e të dhënave të sekuencës specifike të vargut
● Analiza bioinformatike e shprehjes së gjeneve dhe strukturës së transkriptit
Avantazhet
●Ekspertizë e gjerë: Ekipi ynë ka përpunuar mbi 600,000 mostra në BMKgene, duke përfshirë lloje të ndryshme mostrash si kulturat e qelizave, indet dhe lëngjet e trupit. Ne sjellim një përvojë të pasur për çdo projekt dhe kemi përfunduar me sukses mbi 100,000 projekte mRNA-Seq në fusha të ndryshme kërkimore.
●Kontroll rigoroz i cilësisë: Ne zbatojmë pikat kryesore të kontrollit në të gjitha fazat, nga përgatitja e mostrës dhe bibliotekës deri te sekuenca dhe bioinformatika. Ky monitorim i përpiktë siguron dhënien e rezultateve të vazhdueshme me cilësi të lartë, duke ju siguruar që projekti juaj është në duar të besueshme.
●Shënim gjithëpërfshirës: Ne përdorim shumë baza të dhënash për të shënuar në mënyrë funksionale gjenet e shprehura në mënyrë diferenciale (DEG) dhe për të kryer analizat përkatëse të pasurimit. Kjo qasje gjithëpërfshirëse ofron njohuri mbi proceset qelizore dhe molekulare që qëndrojnë në bazë të përgjigjes së transkriptomit, duke siguruar që ju të jeni plotësisht të informuar për rezultatet e projektit tuaj.
●Mbështetje pas shitjes: Angazhimi ynë shtrihet përtej përfundimit të projektit me një periudhë shërbimi pas shitjes 3-mujore. Gjatë kësaj kohe, ne ofrojmë ndjekjen e projektit, ndihmë për zgjidhjen e problemeve dhe sesione pyetjesh dhe përgjigjesh për të adresuar çdo pyetje në lidhje me rezultatet.
Kërkesat e mostrës dhe dorëzimi
| Biblioteka | Strategjia e renditjes | Të dhënat e rekomanduara | Kontrolli i cilësisë |
| Poli A i pasuruar | Ndriçues PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 Gb | Q30≥85% |
Kërkesat e mostrës:
Nukleotidet:
| Konk.(ng/μl) | Sasia (μg) | Pastërti | Integriteti | |
| Biblioteka standarde | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ndotje e kufizuar ose pa proteina ose ADN e treguar në xhel. | Për bimët: RIN≥4.0; Për kafshët: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; lartësi bazë e kufizuar ose aspak |
| Biblioteka Drejtuese | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ndotje e kufizuar ose pa proteina ose ADN e treguar në xhel. | Për bimët: RIN≥4.0; Për kafshët: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; lartësi bazë e kufizuar ose aspak |
● Bimët:
Rrënja, kërcelli ose petali: 450 mg
Gjethja ose fara: 300 mg
Fruta: 1.2 g
●Kafsha:
Zemra ose zorrë: 300 mg
Të brendshmet ose truri: 240 mg
Muskujt: 450 mg
Kockat, flokët ose lëkura: 1 g
● Artropodët:
Insektet: 6 g
Krustace: 300 mg
● Gjak i plotë: 1 tub
● Qelizat: 106 qelizat
Dorëzimi i mostrës së rekomanduar
Enë: tub centrifuge 2 ml (Folja e kallajit nuk rekomandohet)
Etiketimi i mostrës: Grup+përsëritje p.sh. A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Dërgesa:
1. Akull i thatë: Mostrat duhet të paketohen në thasë dhe të varrosen në akull të thatë.
2. Tubat e tabelës së ARN-ve: Mostrat e ARN-së mund të thahen në tubin e stabilizimit të ARN-së (p.sh. RNAstable®) dhe të dërgohen në temperaturën e dhomës.
Rrjedha e punës së shërbimit
Dizajni i eksperimentit
Dorëzimi i mostrës
Ekstraktimi i ARN-së
Ndërtimi i bibliotekës
Sekuenca
Analiza e të dhënave
Shërbimet pas shitjes
Bioinformatika
Eukariote Rrjedha e punës e analizës së sekuencës së mRNA
Bioinformatika
ØKontrolli i cilësisë së të dhënave të papërpunuara
ØRreshtimi i gjenomit referues
ØAnaliza e strukturës së transkriptit
ØKuantifikimi i shprehjes
ØAnaliza e shprehjes diferenciale
ØShënimi dhe pasurimi i funksionit
Rreshtimi i gjenomit të referencës
Ngopja e të dhënave
Korrelacioni i mostrës dhe vlerësimi i replikatave biologjike
Gjenet e shprehura në mënyrë diferenciale (DEGs)
Shënimi funksional i DEG-ve
Pasurimi funksional i DEG-ve
Eksploroni përparimet e lehtësuara nga shërbimet e sekuencës eukariote NGS mRNA të BMKGene përmes një koleksioni të kuruar publikimesh.
Huang, L. et al. (2023) 'Triklosani dhe triklokarbani dobësojnë kapacitetin nuhatës të peshkut të kuq duke kufizuar njohjen e aromës, duke ndërprerë transduksionin e sinjalit të nuhatjes dhe duke shqetësuar përpunimin e informacionit të nuhatjes', Water Research, 233, f. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus rrëmben p11 njerëzore për të ridrejtuar fagozomet që përmbajnë kërpudha në rrugë jo-degraduese', Cell Host & Microbe, 31(3), f. 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) 'Faktorët e transkriptimit TCP të përfshirë në zhvillimin e kërcellit të Ma Bamboo (Dendrocalamus latiflorus Munro)', Kufijtë në shkencën e bimëve, 13, f. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) 'Genomi i Chrysanthemum lavandulifolium dhe mekanizmi molekular që bazohet në lloje të ndryshme të kapitulumit', Kërkimet e Hortikulturës, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie et al. (2023) "Një nanoreaktor kaskadë për rritjen e terapisë sonodinamike mbi kancerin kolorektal nëpërmjet rritjes sinergjike ROS dhe bllokimit të autofagjisë", Nano Sot, 49, f. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
