Bibliotekat e paracaktuara të DNBSEQ
Tiparet
>Platforma:Mgi-dnbseq-t7
>Mënyrat e sekuencave:PE150
>Transferimi i bibliotekave të Illumina nëMgi:Mundësimi i sekuencave të vëllimeve të larta të të dhënave me kosto të ulët.
>Kontrolli i cilësisë së bibliotekave para sekuencave.
>Sekuencimi i të dhënave QC dhe shpërndarja:Dorëzimi i raportit të QC dhe të dhënave të papërpunuara në formatin FASTQ pas demultiplexing dhe filtrimit lexon Q30.
Avantazhe
>Shkathtësia e shërbimeve të sekuencave:Konsumatori mund të zgjedhë të rendisë sipas korsisë ose sasisë së të dhënave.
>Prodhimi i lartë i të dhënave:1500 GB/korsi
>Dorëzimi i sekuencave Raporti i QC:me metrikë të cilësisë, saktësinë e të dhënave dhe performancën e përgjithshme të projektit të sekuencave.
>Procesi i sekuencave të pjekur:me kohë të shkurtër kthimi.
>Kontroll rigoroz i cilësisë: Ne zbatojmë kërkesa të rrepta të QC për të garantuar shpërndarjen e rezultateve me cilësi të lartë vazhdimisht.
Kërkesat e mostrës
| Shuma e të dhënave (x) | Përqendrimi (qpcr/nm) | Vëllim | |
| Korsi e pjesshme
| X ≤ 10 GB | ≥ 1nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ||
| Korsi | Për korsi | ≥ 1.5 nm / pishinë bibliotekare | Μ 25 μl / pishinë bibliotekare |
Përveç përqendrimit dhe sasisë totale, kërkohet edhe një model i përshtatshëm i pikut.
Shënim: Sekuencimi i korsisë së bibliotekave me diversitet të ulët kërkon Phix Spike-In për të siguruar thirrje të fuqishme bazë.
Ne ju rekomandojmë të paraqisni biblioteka të paracaktuara si mostra. Nëse keni nevojë për bmkgene për të kryer bashkimin e bibliotekës, ju lutemi referojuni
Kërkesat e bibliotekës për sekuencat e pjesshme të korsisë.
Madhësia e bibliotekës (Harta e Kulmit)
Kulmi kryesor duhet të jetë brenda 300-450 bp.
Bibliotekat duhet të kenë një kulm të vetëm kryesor, pa ndotje të përshtatësit dhe pa dimers abetare.
Rrjedhë pune e shërbimit
Raporti i QC i Bibliotekës
Një raport mbi cilësinë e bibliotekës është dhënë para sekuencave, vlerësimit të shumës së bibliotekës dhe copëzimit.
Sekuencimi i Raportit QC
Tabela 1. Statistikat mbi të dhënat e sekuencave.
| ID e mostrës | Bmkid | Raw lexon | Të dhëna të papërpunuara (BP) | Lexime të pastra (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717.867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figura 1. Shpërndarja e cilësisë së bashku në secilin mostër
Figura 2. Shpërndarja e përmbajtjes bazë
Figura 3. Shpërndarja e përmbajtjes së leximit në të dhënat e sekuencave
