16S/18S/Sekuencimi i tij i ampliconit-NGS
Karakteristikat e shërbimit
Plat Platforma e Sekuencimit: Illumina Novaseq.
● Amplifikimi i rajoneve të shkurtra të 16 -të, 18 -të dhe e tij, midis objektivave të tjerë të amplifikimit.
● Zgjedhjet fleksibël të ampliconit.
Experience Përvoja e mëparshme e projektit me objektiva të shumta amplifikimi.
Avantazhet e shërbimit
>Pa izolim:Identifikimi i shpejtë i përbërjes mikrobike në mostrat e mjedisit.
>Rezolucion i lartë: Në përbërës të ulët në mostrat e mjedisit.
>E zbatueshme gjerësisht: Studime të ndryshme të komunitetit mikrobik.
>Analizë gjithëpërfshirëse bioinformatike: Paketa e fundit Qiime2 (pasqyrë sasiore në ekologjinë mikrobike) me analiza të ndryshme për sa i përket bazës së të dhënave, shënimit, OTU/ASV.
>Ekspertizë e gjerë: Me 150 mijë projekte të sekuencave të ampliconit të kryera çdo vit, BMKGENE sjell një dekadë përvojë, një ekip analize shumë të aftë, përmbajtje gjithëpërfshirëse dhe mbështetje të shkëlqyeshme pas shitjes.
Specifikimet e shërbimit
| Bibliotekë | Strategjia e sekuencave | Të dhënat e rekomanduara |
| Amplicon | Illumina PE250 | 50/100/300K Etiketa (lexoni çifte) |
Kërkesat e shërbimit
| Përqendrimi (ng/μl) | Shuma totale (NG) | Vëllimi (μl) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Tokë/llum: 1-2g
Contents Përmbajtja e zorrëve-Animal: 0.5-2g
Cont PTRMBAJTJA E TJERA-SEKTE-SEKT: 0,1-0.25G
● Sipërfaqja e bimëve (sedimenti i pasuruar): 0.1-0.5g
Sed Sedimenti i pasuruar i Fermentimit të Supës): 0.1-0.5g
● Feces (kafshë të mëdha): 0.5-2g
● Feces (miu): 3-5Grains
Fluid Lëngu i lavazhit alveolar pulmonar: Letër filtri
● Shtup Vaginal: 5-6 shtupë
● Shtupat e lëkurës/gjenitale/pështyma/indet e buta orale/shtupat e faringut/shtupat e rektumit: 2-3 shtupa
Mic Mikroorganizmat sipërfaqësorë: Letër filtri
● Uji/Ajri/Biofilmi: Letër filtri
● Endofitet: 1-2g
● Pllakë dentare: 0.5-1g
Rrjedha e punës së shërbimit
Dorëzimi i mostrës
Ndërtim bibliotekash
Sekuencim
Analiza e të dhënave
Shërbime pas shitjes
Përfshinë analizën e mëposhtme:
- Kontrolli i cilësisë së të dhënave të papërpunuara
- Grumbullimi /de-zhurma OTU (ASV)
- Shënim otu
- Analiza e Diversitetit Alpha: Indekse të shumta, përfshirë Shannon, Simpson dhe Ace.
- Analiza e diversitetit beta
- Analizë ndër-grupore
- Analiza e korrelacionit: Midis faktorëve mjedisorë dhe përbërjes jashtë dhe diversitetit
- Parashikimi i gjenit funksional 16S
Histogram i shpërndarjes taksonomike
Harta e nxehtësisë së grumbullimit të bollëkut taksonomik
Analiza e diversitetit alfa: Kurba e rrallimit
Analiza e diversitetit beta: NMDS
Analiza Intergroup: Zbulimi i Biomarkerit të Lefse
Eksploroni përparimet e lehtësuara nga shërbimet e sekuencave të ampliconit të BMKGene me Illumina përmes një koleksioni të kuruar të botimeve.
Dong, C. et al. (2022) 'Asambleja, mikrobiota thelbësore dhe funksioni i tokës së rizosferës dhe mikrobiotës së lëvores në Eucommia ulmoides', Kufijtë në Mikrobiologji, 13. DOI: 10.3389/FMICB.2022.855317/Full.
Li, Y. et al. (2023) 'Transplantimi i konsorciumeve bakteriale sintetike për trajtimin e vaginozës bakteriale të shkaktuar nga Gardnerella vaginalis në minj', mikrobiomë, 11 (1), f. 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. dhe Liu, H. (2022) 'Mikrobiomet e pluhurit të ajrit të mbledhura gjatë eksperimentit të Mbështetjes së Jetës Bioregenerative të Mbyllur me bazë në tokë "Pallati Lunar 365", Mikrobiomet e Mjedisit, 17 (1), f. 1-20. doi: 10.1186/s40793-022-00399-0/figura/8.
Yin, S. et al. (2022) 'Bollëku i varur nga lëndët e para të gjeneve funksionale që lidhen me transformimin e azotit humbjen e kontrolluar të azotit në kompostim', Bioresource Technology, 361, f. 127678. Doi: 10.1016/j.biortech.2022.127678.
