-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
transcriptomics Spatial transcriptomics waxay u taagan tahay safka hore ee hal-abuurnimada sayniska, taasoo awood u siinaysa cilmi-baarayaasha inay dhexgalaan qaababka muujinta hidde-sidaha ee qallafsan ee unugyada dhexdooda iyagoo ilaalinaya xaaladdooda bannaan. Meelo kala duwan oo ay ku jiraan, BMKGene waxay soo saartay BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, iyada oo ku faanta xallinta la xoojiyey ee 3.5µm, gaarey tirada unugyada hoose, oo awood u siisay dejinta xallinta heerar badan. Chip-ka S3000, oo leh ku dhawaad 4 milyan oo dhibco ah, ayaa ka shaqeeya microwells oo ay ku dahaaran yihiin kuul ay ku rakiban yihiin baarkin meel bannaan oo lagu soo qabto. Maktabad cDNA ah, oo ay ku hodmeen barcode-yada bannaan, ayaa laga soo diyaariyey chip-ka S3000 oo ka dibna lagu sii raacay madal Illumina NovaSeq. Isku darka shaybaarrada barcodeed ee meel bannaan iyo UMI-yada waxay hubinayaan saxnaanta iyo gaarnimada xogta la sameeyay. Chip-ka BMKManu S3000 waa mid aad u wanagsan, isaga oo bixiya dejinta xallinta heerar kala duwan oo si fiican loogu hagaajin karo unugyo kala duwan iyo heerarka la doonayo ee faahfaahinta. Laqabsigani wuxuu u dhigayaa chip-ka doorasho aad u wanaagsan oo loogu talagalay daraasadaha transcriptomics ee kala duwan, hubinta isku-dhafka boosaska saxda ah oo leh buuq yar. Isticmaalka tignoolajiyada kala qaybinta unugyada ee BMKManu S3000 waxay awood u siinaysaa xadaynta xogta qoraalka ee xuduudaha unugyada, taas oo keenta falanqayn leh macne bayooloji oo toos ah. Intaa waxaa dheer, xallinta la wanaajiyey ee S3000 waxay keenaysaa tiro badan oo hidde-sideyaal ah iyo UMI-yada laga helay unug kasta, taas oo awood u siinaysa falanqayn aad u sax ah oo ku saabsan qaababka qoraallada boosaska iyo ururinta unugyada.
-
Hal-nuklei RNA Taxane
Horumarinta qabsashada hal unug iyo farsamooyinka dhismaha maktabadda caadiga ah, oo ay weheliso isku xigxiga-sare, ayaa wax ka beddelay daraasadaha muujinta hidda-wadaha ee heerka unugga. Horumarkaani wuxuu ogolaanayaa in si qoto dheer oo qoto dheer loo falanqeeyo tirada unugyada adag, ka gudubka xaddidaadyada la xidhiidha celceliska muujinta hidda-wadaha ee dhammaan unugyada iyo ilaalinta kala duwanaanshaha dhabta ah ee dadkan. Iyadoo isku xigxiga hal unug ee RNA (scRNA-seq) uu leeyahay faa'iidooyin aan la dafiri karin, waxay la kulmeysaa caqabado unugyo gaar ah halkaas oo abuurista hal unug ka-joojin ay caddeyso mid adag oo u baahan muunado cusub. Markay tahay BMKGene, waxaanu wax ka qabanaynaa caqabadan annagoo bixinayna isku xigxiga hal-nucleus RNA (snRNA-seq) anagoo adeegsanayna tignoolajiyada casriga ah ee 10X Genomics Chromium. Habkani waxa uu balaadhinayaa shaybaarrada kala duwan ee lagu heli karo falanqaynta qoraalka ee heerka hal unug.
Go'doominta nuclei-yada waxaa lagu dhammeeyaa hal-abuurka 10X Genomics Chromium chip, oo leh nidaam siddeed kanaal ah oo microfluidics ah oo leh laba isgoys. Nidaamkan dhexdiisa, kuullaha jeelka ah ee ku jira barcodes, primers, enzymes, iyo hal nukleus ayaa ku jira dhibcaha saliidda ee nanoliter-ka, samaynta Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Samaynta GEM ka dib, lysis unug iyo siidaynta barcode waxay ku dhacdaa GEM kasta. Ka dib, molecules mRNA waxay maraan qoraal kale oo cDNAs ah, oo lagu daro 10X barcodes iyo Aqoonsiyada Molecular Unique (UMIs). CDNA-yadan ayaa markaa la marsiiyaa dhismo isku xigxig oo caadi ah, taasoo sahlaysa sahamin adag oo dhamaystiran oo ah astaanta muujinta hidda-wadaha ee heerka unug-kaliya.
Platform: 10× Genomics Chromium iyo Illumina NovaSeq Platform
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
transcriptomics Spatial transcriptomics waa tignoolajiyada gees-goynta ah oo u oggolaanaysa cilmi-baarayaasha inay baaraan qaababka muujinta hidda-wadaha ee unugyada dhexdooda iyagoo ilaalinaya xaaladdooda bannaan. Mid ka mid ah madal awood leh oo ku taal boggan waa 10x Genomics Visium oo ay weheliso isku xigxiga Illumina. Mabda'a 10X Visium wuxuu ku dul yaal jajab gaar ah oo leh meel laqabsado oo loo qoondeeyay halkaasoo qaybaha unugyada la dhigo. Goobtan la qabsashada waxa ay ka kooban tahay baro kood leh, oo mid walba u dhiganta meel bannaan oo gaar ah oo ku dhex jirta unugyada. Unugyada RNA ee la qabtay ee unugga ayaa markaas lagu calaamadeeyay tilmaameyaal unugyo gaar ah (UMIs) inta lagu guda jiro habka qoraalka qoraalka. Barcodeedkan iyo UMI-yada waxay awood u siinayaan khariidad sax ah oo sax ah iyo qiyaasida muujinta hidda-wadaha ee xallinta hal unug. Isku darka shaybaarrada barcodeed ee meel bannaan iyo UMI-yada waxay hubinayaan saxnaanta iyo gaarnimada xogta la sameeyay. Isticmaalka tignoolajiyadan Spatial Transcriptomics, cilmi-baarayaashu waxay heli karaan faham qoto dheer oo ku saabsan abaabulka ballaaran ee unugyada iyo isdhexgalka unugyada kakan ee ka dhex dhaca unugyada, iyagoo siinaya aragtiyo qiimo leh oo ku saabsan hababka asaasiga ah ee hababka bayoolojiga ee dhinacyo badan, oo ay ku jiraan oncology, neuroscience, bayoolaji korriinka, immunology. , iyo cilmiga dhirta.
Platform: 10X Genomics Visium iyo Illumina NovaSeq
