Khariidadda kuleylka
Qalabka Heatmap-ku wuxuu aqbalaa faylka xogta matrixka sidii gelinta wuxuuna u oggolaanayaa isticmaaleyaasha inay shaandheeyaan, caadiyeeyaan oo ay xogta ururiyaan. Kiiska isticmaalka aasaasiga ah ee khariidadaha kulaylka waa falanqaynta kooxeed ee heerka muujinta hidde-sidaha ee u dhexeeya muunado kala duwan.
Tilmaamaha Hiddaha
Qalabka Annotation Gene wuxuu qabtaa tafatirka hiddo-wadaha iyadoo ku saleysan isku xigxiga isku xigxiga ee galitaanka galka FASTA ee ka dhanka ah xog uruurin kala duwan.
Aaladda Aasaasiga ah ee Raadinta Isku toosinta Gudaha (BLAST)
Qalabka BLAST waa nooca isku dhafan ee BMKCloud ee NCBI BLAST waxaana loo isticmaali karaa in lagu qabto isla hawlo la mid ah iyadoo la isticmaalayo xogta lagu shubay akoontada BMKCloud.
CDS_UTR Saadaasha
Qalabka Saadaasha CDS_UTR waxaa loogu talagalay in lagu saadaaliyo gobollada codaynta (CDS) iyo gobollada aan codeeyn (UTR) ee taxanaha qoraalka la bixiyay ee ku saleysan natiijooyinka BLAST ee ka dhanka ah xogta borotiinka ee la yaqaan iyo natiijooyinka saadaalinta ORF.
Shirqoolkii Manhattan
Qalabka Manhattan Plot wuxuu awood u siinayaa soo bandhigida tijaabooyinka muunada sare waxaana badanaa loo adeegsadaa daraasadaha ururka genome-wide (GWAS).
Sawirka Circos
Qalabka jaantuska CIRCOS wuxuu bixiyaa muuqaal hufan oo ku saabsan sida astaanta genomiga loogu qaybiyay genome-ga. Astaamaha caanka ah waxaa ka mid ah tirada loci, SNPs, InDels, kala duwanaanshaha nambarada qaab dhismeedka iyo koobiga.
Kobcinta Gene Ontology (GO)
Qalabka Kobcinta GO wuxuu bixiyaa falanqaynta kobcinta shaqaynaysa. Software-ka aasaasiga ah ee qalabkani waa xirmada TopGO-Bioconductor, oo ay ku jiraan falanqaynta muujinta kala duwan, falanqaynta kobcinta GO iyo aragtida natiijooyinka.
Falanqaynta Shabakadda Wada-hadalka Hidde ee Miisaan leh (WGCNA)
WGCNA waa habka macdan qodista oo si weyn loo isticmaalo si loo ogaado unugyada wada-muujinta hidda-wadaha. Waa mid lagu dabaqi karo xog-ururineed oo kala duwan oo ay ku jiraan xog-ururinta iyo muujinta hiddaha NGS.
InterProScan
Qalabka InterProScan wuxuu bixiyaa falanqaynta iyo kala soocida isku xigxiga borotiinka InterPro.
GO KEGG kobcinta
Qalabka Kobcinta GO KEGG waa naqshad si loo soo saaro GO-ga kobcinta histogaram, KEGG tayeynta histogaraamka iyo dariiqa kobcinta KEGG oo ku saleysan jaangooyooyin hiddo-sideyaal ah iyo sharraxaad u dhiganta.