mRNA-seq (NGS) - De novo

Taxanaha mRNA waxa uu ogolaadaa in la soo bandhigo dhamaan qoraalada mRNA ee unugyada marka la eego xaalado gaar ah waana tignoolajiyad si weyn loo isticmaalo meelo cilmi baaris oo kala duwan. Dhuumaha BMKCloud De novo mRNA-seq waxaa loogu talagalay in lagu falanqeeyo maktabadaha isku xigxiga ee poly-A marka aan la helin genome tixraaceed. Dhuumaha waxay ka bilaabmaan tayada tayada, oo ay ku xigtode novoururinta qoraalka iyo xulashada unigene set. Falanqaynta qaabdhismeedka unigene waxa ay saadaalisaa isku xigxiga koodaynta (CDS) iyo soo noqnoqoshada fudud ee isku xigxiga (SSR). Ka dib, falanqaynta muujinta kala duwani waxay helaysaa hiddo-wadeyaal si kala duwan loo muujiyay (DEGs) oo ka mid ah xaaladaha la tijaabiyay, oo ay ku xigto sharraxaad shaqeyn ah iyo kobcinta DEGs si loo soo saaro fikradaha noolaha.