Exclusive Agency for Korea

Canner-03

Wax soo wadaban

Genetics Eventicy

Barnaamijyada horudhaca ah waa adeeg hufan oo dhameystiran oo loogu talagalay in lagu siiyo turjubaan fasiraad ah oo isbeddel ah oo ka dhex jira koox shaqsiyaad ah, oo ay ku jiraan SNPs, oo ay kujirto SNPS, Invs, iyo CNVs. Adeeggan wuxuu ka kooban yahay dhammaan falanqaynta muhiimka ah ee loo baahan yahay si loo qiimeeyo isbeddelada isbeddelka iyo astaamaha hidda-wadaha ee dadka, oo ay ku jiraan qiimeynta qaab dhismeedka dadka, kala duwanaanta hidda-wadaha, kala duwanaanta hidda-socodka, iyo cilaaqaadka is-beddelka. Intaa waxaa sii dheer, waxay ku habsatay daraasadaha qulqulka hidda-wadaha, taas oo awood u siineysa qiyaasta tirada dadka wax ku oolka ah iyo waqtiga kala-goysyada. Daraasadaha hiddaha horudhaca ee horusocodka ah waxay dhaliyaan aragtiyo qiimo leh asal ahaan iyo laqabsashada noocyada.

BMKGENE, waxaan bixinaa laba dariiqo oo loogu talagalay in lagu sameeyo daraasado hiddo-wadeyaal ah oo ku saabsan dadka waaweyn In kasta oo ay WGS ku habboon tahay in yar yar, SLAF wuxuu u soo baxaa inuu yahay mid ku habboon oo wax ku ool ah oo loogu talagalay barashada dadka waaweyn ee leh qaarada dheer, si wax ku ool ah u yareeya kharashaadka isku xirka.


Faahfaahinta adeegga

Bioinformatics

Natiijooyinka Demo

Daabacaadda Feejignaanta

Faa'iidooyinka adeegga

1-aad hiddo-wade

Takagi et al.,Joornaalka geedka, 2013

Falanqaynta Bioinform-ka dhameystiran:Awood u siinta qiyaasta kala duwanaanta hidda-wada-hadalka, kaas oo ka tarjumaya suurtagalnimada isbeddelka noocyada, iyo muujinta xiriirkii phylogenetic la isku halleyn karo ee ka dhexeeya noocyada ku habboon abuurka isbedelka iyo isbeddelka isbarbar socda

Falanqaynta Falanqaynta Ikhtiyaariga ah: sida qiyaasta waqtiga kala-jajabinta iyo xawaaraha ku saleysan kala duwanaanshaha heerka nucleotide iyo amino acids.

Khibrad ballaaran iyo diiwaanno Daabacaadda: BMKGENE waxay uruursatay khibradaha ballaaran ee mashaariicda guud ee dadka iyo horumarka ka badan 15 sano, oo daboolaya kumanaan nooc, oo ay gacan ka geysteen in ka badan 1000 mashruucyo heer sare ah oo lagu daabacay suuqa dabiiciga ah, dhirta molikal-ka, joornaalka dhirta, iwm.

● Koox aad u wanaagsan oo xirfad leh iyo wareegga falanqaynta gaagaaban: waayo-aragnimo weyn oo ku saabsan falanqaynta samafalka ee horumarsan, kooxda BMKGENE GMKGENE waxay keenaysaa falanqeyn dhameystiran oo leh waqti deg deg ah oo istaagaya.

● Taageerada iibka ka dib:Balankeenna ayaa ka dheereeya dhammaystirka mashruuca ee leh muddo 3 bilood ah oo iib ah ka dib. Inta lagu jiro waqtigan, waxaan bixinaa dabagal dabagal mashruuc, gargaar dhibaatayn, iyo Q & SS & Kalfadhiyo si wax looga qabto wixii su'aalo ah ee la xiriira natiijooyinka.

Faahfaahinta adeegga iyo shuruudaha

Nooca isku xigxiga

Qiyaasta shacabka ee lagu taliyay

Istaraatiijiyadda isku xigta

Shuruudaha Nuclotide

Isugeynta Genome oo dhan

≥ 30 Shakhsiyaad, oo leh ≥ 10 qof oo ka socda koox hoosaad kasta

 

10x

U fiirsashada: ≥ 1 ng / μl

Wadarta lacagta 30ng

Xaddidan ama xaalufinta ama faddaraynta

Qeyb-goyn gaar ah (SLAF)

Tooska Tooska ah:

10x

Tirada calaamadaha:

<400 MB: WGS waa lagu talinayaa

<1GB: 100K calaamadaha

1GB

> 2GB: 300K calaamadaha

Max 500K calaamadaha

U fiirsashada ≥ 5 ng / μl

Wadarta lacagta ≥ 80 ng

Nanodrop OD260 / 280 = 1.6-2.5

Agaresol Gel: Maya ama xadidan ama faddarayn

 

Socodka shaqada adeegga

Muunad Qc

Naqshadeynta Tijaabada

keenista muunad

Keenista muunad

Diyaarinta Maktabadda

Dhismaha Maktabadda

Kala xidowdo

Kala xidowdo

Falanqaynta Xogta

Falanqaynta Xogta

Kadib Adeegyada Iibsiga

Adeegyada ka dib


  • Hore:
  • Xiga:

  • SLAF 流程图 -8.4 改 -01

    Adeegga waxaa ka mid ah falanqaynta qaab dhismeedka dadka (Phylogeletic Geedka dadweynaha, shaxda Phca, shaxda ku xirnaanta dadka), kala duwanaanta dadka, iskuxirka (xulashada bulshada ee xulashada ah). Adeeggu sidoo kale waxaa ka mid ah falanqaynta loo habeeyay (tusaale, waqtiga kala-baxa, socodka hidda-wadaha).

    *Natiijooyinka Demo ee halkan lagu muujiyey waxay dhammaantood ka yimaadeen Gnomes-ka oo lagu daabacay BMKGENE

    1. Falanqaynta Falanqaynta waxaa ku jira Dhismaha Geedka Phylogeletic, qaab dhismeedka dadka iyo PCA-ga ku saleysan kala duwanaanshaha hidda-socodka.

    Phylotenetic Geedka wuxuu matalaa cilaaqaadyo cashuureed iyo horumar leh oo ka mid ah noocyada abtirsiinyo caan ah.
    PCA-ga ayaa ujeedadiisu tahay inuu u muuqdo isku soo dhawaanshaha dadka ka hooseeya dadka-hoosaadka.
    Qaab-dhismeedka dadka ayaa muujinaya jiritaanka dadka ka kooban xubno gaar ah oo ka kooban kuwa ka socda dhammaantood ee loo yaqaan 'Alelle'.

    3-1phylovenole-geedka 3-2pca 3-3popopopople-qaab

    Chen, et. Al.,Pnaas, 2020

    2.ltlactSoltstole

    Guryaha xulashada ah waxaa loola jeedaa geedi socodka ay tahay in aalluhu soo xulay oo soo noqnoqoshada heerarka dhexdhexaad ee iskuxiran ayaa la kordhiyaa oo ay yihiin kuwa goobaha la furay oo ka dhalanaya gobolka.

    Ogaanshaha Genome-balaaran ee gobollada la xushay ayaa laga baaraandegayaa iyada oo la xisaabinayo iyadoo la xisaabinayo tirada dadka hidda-wadaha (π, FST, tajima oo dhan daaqad isbadal ah (100 kb) oo ah tallaabo gaar ah (10 kb).

    Kala duwanaanshaha Nuclotide (π)
    4Naclootide-kala-duwanaanta (π)

    Tajima's d
    5tajima's-d

    Tusmada hagaajinta (FST)

    6Fixi-yada-tusmada (FST)

    Wu, et. Al.,Warshad molikalar, 2018 2018

    3.gene socodka

    7gene socodka

    Wu, et. Al.,Warshad molikalar, 2018 2018

    4.Dographic Taariikhda

    8demographicchic-Taariikh

    Zhang, et. al.,Dabeecadda dabiiciga ah & isbeddelka, 2021

    5.Diverence Waqtiga

    9Diverence-waqtiga

    Zhang, et. al.,Dabeecadda dabiiciga ah & isbeddelka, 2021

    Sahaminta horumarka ay fududeysay adeegyada hidde-ka-barashada ee BMKGE ee BMKGE-ka ee loo maro aruurinta daabacaadda daabacaadaha:

    Hassanyar, Ak Et al. .Joornaalka caalamiga ah ee cilmiga molikalar, 24 (7). doi: 10.3390 / Ijmss24076238.

    Chai, J. et al. (2022) 'Daahnimada duurjoogta ah, Salamam saafiga ah ee caadiga ah ee Shiinaha ayaa abuuraya fursado dhowrista cusub',Cilmi baarista zoological, 2022, vol. 43, qodobka 3, bogagga: 469-480, 43 (3), pp. 469-480. doi: 10.24272 / j.sn.2095-8137.2022.101.

    Han, M. et al. (2022) Qaabka Phylogegographical iyo Tirada Dadweynaha ee EYSMUS SIBIRICUS L. On Qingahai-Tibetan Plateau ',Xuduudaha ee sayniska dhirta, 13, p. 882601. DOI: 10.3389 / FPLS.2022.882601 / Bibtex.

    Wang, J. et al. (2022) 'Insights-ka galmada ee isbedelka dhaadheer ee ka yimaada urur koromosoome heer-heer-ku-meel-gaar ah oo ka mid ah deganka bulshada ee dib-u-haynta dedan',Cilmi baarista beeraha, 9. do: 10.1093 / HR / UHAC021.

    hel xigasho

    Halkan ku qor farriintaada oo noo soo dir

    Farriintaada noo soo dir: