Taxanaha Amplicon (16S/18S/ITS)

Amplicon (16S/18S/ITS) isku xigxiga leh Illumina waa hab lagu falanqeeyo kala duwanaanshiyaha microbial iyadoo la aqoonsanayo profiles microbial sida ay isku xigxiga ka dibna isku dayaan in ay qeexaan hodantinimada bulshada iyo kala duwanaanshaha gudahood muunad kasta iyo inta u dhaxaysa muunado. Dhuumaha BMKCloud Amplicon (NGS) ayaa u oggolaanaya falanqaynta 16S, 18S, ITS iyo hiddo-wadeyaal badan oo shaqeynaya. Waxay ku bilaabataa akhrinta jarista, isu imaatinka-dhamaadka akhrinta iyo qiimaynta tayada, oo ay ku xigto ururinta akhrin la mid ah si ay u abuurto Unugyada Cashuuraha Hawlgelinta (OTUs) ee loo isticmaalo lix qaybood oo falanqayn oo kala duwan. Taxonomic taxonomic waxa ay bixisaa macluumaad ku saabsan tirada badnaanta iyo ka kooban yahay muunad kasta, halka alfa iyo beta kala duwanaanshiyaha falanqaynta diiradda saarayaa kala duwanaanshaha microbial gudahood iyo inta u dhaxaysa muunado, siday u kala horreeyaan. Falanqaynta kala duwanaanshiyaha kooxaha waxay helayaan OTU-yada ku kala duwan iyadoo la adeegsanayo imtixaannada parametric iyo non parametric, halka falanqaynta isku xidhku ay la xidhiidho kala duwanaanshahan arrimaha deegaanka. Ugu dambeyntiina, badnida hidda-wadaha shaqeyneysa ayaa la saadaaliyay iyadoo lagu saleynayo tirada badan ee hidde-sidaha, iyadoo la siinayo aragtida shaqada iyo deegaanka muunad kasta.