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条形 fu'a-03

Tala Fou

GENOME

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Chromosome-scale faʻapotopotoina ma auʻiliʻiliga o le biomass crop Miscanthus lutarioriparius genome

Nanopore sequencing | Ilumina | Talofa-C | RNA-fa'asologa | Filogeni

I lenei suʻesuʻega, Biomarker Technologies na tuʻuina atu le lagolago faʻapitoa i le Nanopore sequencing, de novo genome assembly, Hi-C assisted assembly, etc.

Pu'upu'u

Miscanthus, o se la'au fa'ato'aga rhizomatous, e tele lona gafatia mo le gaosiga o le bioenergy mo lona maualuga o le biomass ma le fa'apalepale o fa'alavelave. Matou te lipotia se fa'apotopotoga fa'a-chromosome oMiscanthus lutarioripariusgenome e ala i le tuʻufaʻatasia o Oxford Nanopore sequencing ma Hi-C tekinolosi. O le faʻapotopotoga 2.07-Gb e aofia ai le 96.64% o le genome, faʻatasi ai ma le N50 o le 1.71 Mb. O fa'asologa o le centromere ma le telomere o lo'o tu'ufa'atasia mo chromosome uma e 19 ma chromosome 10. Allotetraploid tupuaga o le M. lutarioriparius ua faʻamaonia i le faʻaaogaina o satelite centromeric toe fai. O le fausaga o le genome tetraploid ma le tele o suiga o le chromosomal e faatatau i le sorghum o loʻo faʻaalia manino. Tandem lua genes oM. lutarioripariuso lo'o fa'atamaoaigaina galuega e le gata i tu'utu'uga e feso'ota'i ma le fa'alavelave fa'alavelave, ae o le biosynthesis o puipui sela. O aiga kene e fesoʻotaʻi ma faʻamaʻi faʻamaʻi, biosynthesis puipui puipui ma felauaiga uʻamea ua matua faʻalauteleina ma faʻaleleia. O le faʻalauteleina o nei aiga atonu o se faʻavae taua genomic mo le faʻaleleia o uiga mataʻina oM. lutarioriparius.

Fa'amaumauga autu o fa'apotopotoga genome

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Ata. Vaaiga lautele o le M. lutarioriparius genome assembly

Tala Fou ma Mea Taua e fa'atatau i le fa'asoaina atu o mataupu fa'amanuiaina lata mai ma Biomarker Technologies, fa'amauina o taunu'uga fa'asaienisi fa'apea fo'i ma auala iloga na fa'aogaina i le taimi o su'esu'ega.


Taimi meli: Ian-05-2022

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