Celotno sekvenciranje transkripta - Illumina
Lastnosti
● Dvojna knjižnica za zaporedje celotnega transkripta: izčrpavanje rRNA, ki mu sledi priprava knjižnice PE150
● Popolna bioinformatična analiza mRNA, lncRNA, circrna in miRNA v ločenih poročilih o bioinformatiki
● Skupna analiza vseh izražanja RNA v kombiniranem poročilu, vključno z analizo omrežij CENA.
Prednosti storitev
●Poglobljena analiza regulativnih omrežij: Analiza omrežja CERNA omogoča skupno sekvenciranje mRNA, lncRNA, circrna in miRNA ter izčrpen bioinformatični potek dela.
●Obsežna opomba: Uporabljamo več baz podatkov za funkcionalno označevanje različno izraženih genov (DEG) in izvedemo ustrezno analizo obogatitve, kar zagotavlja vpogled v celične in molekularne procese, na katerih temelji odziv transkripta.
●Obsežno strokovno znanje: S uspešnostjo uspešnega zapiranja več kot 2100 celotnih prepisov v različnih raziskovalnih področjih naša ekipa prinaša veliko izkušenj vsakemu projektu.
●Strog nadzor kakovosti: V vseh fazah izvajamo jedrne kontrolne točke, od vzorčnih in knjižničnih priprave do zaporedja in bioinformatike. To natančno spremljanje zagotavlja dosledno kakovostne rezultate.
●Podpora po prodaji: Naša zaveza se presega zaključek projekta s trimesečnim poprodajnim servisnim obdobjem. V tem času ponujamo nadaljnje spremljanje projektov, odpravljanje pomoči in seje Q&A za reševanje vseh poizvedb, povezanih z rezultati
Vzorčne zahteve in dostava
| Knjižnica | Strategija zaporedja | Priporočeni podatki | Nadzor kakovosti |
| rRNA izčrpana | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Izbrana velikost | Illumina SE50 | 10-20m branje |
Vzorčne zahteve:
Nukleotidi:
| Conc. (Ng/μl) | Količina (μg) | Čistost | Integriteta |
| ≥ 80 | ≥ 1,6 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Omejena ali brez kontaminacije beljakovin ali DNK, prikazana na gelu. | Rin≥6,0 5,0≥28s/18S≥1,0; omejena ali brez osnovne višine |
Priporočena dostava vzorca
Posoda: 2 ml centrifuge cev (kositrna folija ni priporočljiva)
Označevanje vzorca: skupina+ponovitev, npr. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pošiljka:
1. suho-led: Vzorce je treba pakirati v vrečke in pokopati v suhem ledu.
2. Rnastabilne cevi: Vzorci RNA lahko posušimo v cevi za stabilizacijo RNA (npr. Rnastable®) in odposlane pri sobni temperaturi.
Servisni delovni tok
Oblikovanje eksperimenta
Dostava vzorca
Ekstrakcija RNA
Konstrukcija knjižnice
Zaporedje
Analiza podatkov
Po prodajnih storitvah
Bioinformatika
Pregled izražanja RNA
Diferencialno izraženi geni
Analiza CERNA
Diferencialno izražene miRNA in z njimi povezane RNA
Raziščite napredek raziskav, ki jih omogočajo BMKGene 'celotne storitve sekvenciranja transkripta s pomočjo kurirane zbirke publikacij.
Dai, Y. et al. (2022) „Obsežni izražani profili mRNA, lncRNA in miRNA pri kašin-beck bolezni, identificirani z sekvenciranjem RNA“, Molekularni omiki, 18 (2), str. 154–166. doi: 10.1039/d1mo00370D.
Liu, N. Nan et al. (2022) „Analiza transkriptomov v celotni dolžini hladne odpornosti API-jev cerana v gori Changbai v obdobju prezimevanja.“, Gene, 830, str. 146503–146503. doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) „Prednostne naloge, ki temeljijo na veči-omiki, na podlagi konkurenčnih endogenih regulacijskih omrežij RNA pri majhnih celičnih pljučnih rakih: molekularne značilnosti in kandidatov za zdravila ', Frontiers in Oncology, 12, str. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Xu, P. et al. (2022) „Integrirana analiza izražanja ekspresije lncRNA/circrna-miRNA-mRNA razkriva nove vpoglede v potencialne mehanizme kot odgovor na koreninske ogorčice v arašidu“, BMC genomika, 23 (1), str. 1–12. doi: 10.1186/s12864-022-08470-3/številke/7.
Yan, Z. et al. (2022) „Sekvenciranje RNA v celotnem transkriptu poudarja molekularne mehanizme, povezane z vzdrževanjem kakovosti postharvest v brokoliju z rdečim LED obsevanjem“, Postharvest Biology and Technology, 188, str. 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.111878.
