Majhne sekvenciranje RNA-ilumina
Lastnosti
● Priprava knjižnice vključuje korak izbire velikosti
● Bioinformatska analiza, osredotočena na napovedovanje miRNA in njihove cilje
Prednosti storitev
●Obsežna analiza bioinformatike:Omogočanje identifikacije tako znanih kot novih miRNA, identifikacija ciljev miRNA in ustrezno funkcionalno opombo in obogatitev z več bazami podatkov (kegg, GO)
●Strog nadzor kakovosti: V vseh fazah izvajamo jedrne kontrolne točke, od vzorčnih in knjižničnih priprave do zaporedja in bioinformatike. To natančno spremljanje zagotavlja dosledno kakovostne rezultate.
●Podpora po prodaji: Naša zaveza se presega zaključek projekta s trimesečnim poprodajnim servisnim obdobjem. V tem času ponujamo nadaljnje spremljanje projektov, odpravljanje pomoči in vprašanj in vprašanj za reševanje vseh poizvedb, povezanih z rezultati.
●Obsežno strokovno znanje: S uspešnostjo uspešnega zaključka več projektov SRNA, ki zajemajo več kot 300 vrst v različnih raziskovalnih področjih, naša ekipa prinaša veliko izkušenj v vsak projekt.
Vzorčne zahteve in dostava
| Knjižnica | Obnosišče | Priporočeni podatki | Podatki QC |
| Izbrana velikost | Illumina SE50 | 10m-20m branje | Q30≥85% |
Vzorčne zahteve:
Nukleotidi:
| Conc. (Ng/μl) | Količina (μg) | Čistost | Integriteta |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Omejena ali brez kontaminacije beljakovin ali DNK, prikazana na gelu. | Rin≥6,0; 5,0≥28s/18S≥1,0; omejena ali brez osnovne višine |
● Rastline:
Koren, steblo ali cvetni list: 450 mg
List ali seme: 300 mg
Sadje: 1,2 g
● Žival:
Srce ali črevo: 450 mg
Viscera ali možgani: 240 mg
Mišica: 600 mg
Kosti, lasje ali koža: 1,5 g
● členonožci:
Žuželke: 9g
Crustacea: 450 mg
● polna kri: 2 cevi
● Celice: 106 celice
● Serum in plazma:6 ml
Priporočena dostava vzorca
Posoda: 2 ml centrifuge cev (kositrna folija ni priporočljiva)
Označevanje vzorca: skupina+ponovitev, npr. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pošiljka:
1. suho-led: Vzorce je treba pakirati v vrečke in pokopati v suhem ledu.
2. Rnastabilne cevi: Vzorce RNA lahko posušimo v cevi za stabilizacijo RNA (npr. RNASTABLE®) in odposlane v sobni temperaturi.
Servisni delovni tok
Oblikovanje eksperimenta
Dostava vzorca
Ekstrakcija RNA
Konstrukcija knjižnice
Zaporedje
Analiza podatkov
Po prodajnih storitvah
Bioinformatika
● Nadzor kakovosti surovih podatkov
● SRNA klasifikacija
● Poravnava z referenčnim genomom
● Identifikacija znane in nove miRNA
● Diferencialna analiza izražanja miRNA
● Funkcionalno pripisovanje ciljev miRNA
Identifikacija miRNA: struktura in globina
Diferencialna ekspresija miRNA - Hiearchikalno gručanje
Funkcionalna opomba cilja različno izraženih miRNA
Raziščite napredek raziskav, ki jih omogočajo storitve zaporedja SRNA BMKGene s pomočjo kurirane zbirke publikacij.
Chen, H. et al. (2023) „Virusne okužbe zavirajo biosintezo saponina in fotosintezo v Panax Notoginseng ', rastlinsko fiziologijo in biokemijo, 203, str. 108038. Doi: 10.1016/j.plaphy.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) „Protein, ki vsebuje domeno, ki vsebuje domeno, se povezuje z mikroprocesorskimi komponentami za zatiranje biogeneze miRNA“, poroča EMBO, 24 (1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/Suppl_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.Tif.
Yu, J. et al. (2023) „MikroRNA AME-Bantam-3P nadzoruje razvoj larvalnih zenic, tako da cilja na več epidermalnih rastnih faktorjev podobnih domen 8 (Megf8) v Honeybee, API-je . 5726. DOI: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) „Integrirana analiza miRNA in genov, povezanih s kakovostjo mesa, razkriva, da GGA-MIR-140-5P vpliva na odlaganje intramuskularne maščobe pri piščancih, celično fiziologijo in biokemijo, 46 (6), str. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
