-
BMKMANU S3000_Prostorski transkriptom
Prostorska transkriptomika je v ospredju znanstvenih inovacij in omogoča raziskovalcem, da se poglobijo v zapletene vzorce izražanja genov v tkivih, hkrati pa ohranjajo njihov prostorski kontekst. Sredi različnih platform je BMKGene razvil prostorski transkriptomski čip BMKManu S3000, ki se ponaša z izboljšano ločljivostjo 3,5 µm, dosega subcelični obseg in omogoča nastavitve ločljivosti na več ravneh. Čip S3000, ki ima približno 4 milijone točk, uporablja mikrovdolbinice, prekrite s kroglicami, naloženimi s sondami za zajemanje s prostorsko črtno kodo. Knjižnica cDNA, obogatena s prostorskimi črtnimi kodami, je pripravljena iz čipa S3000 in nato sekvencirana na platformi Illumina NovaSeq. Kombinacija prostorsko kodiranih vzorcev in UMI zagotavlja točnost in specifičnost generiranih podatkov. Čip BMKManu S3000 je izjemno vsestranski in ponuja nastavitve ločljivosti na več ravneh, ki jih je mogoče natančno prilagoditi različnim tkivom in želenim nivojem podrobnosti. Ta prilagodljivost postavlja čip kot izjemno izbiro za raznolike študije prostorske transkriptomike, kar zagotavlja natančno prostorsko združevanje v gruče z minimalnim šumom. Uporaba tehnologije segmentacije celic z BMKManu S3000 omogoča razmejitev transkripcijskih podatkov do meja celic, kar ima za posledico analizo, ki ima neposreden biološki pomen. Poleg tega izboljšana ločljivost S3000 povzroči večje število odkritih genov in UMI na celico, kar omogoča veliko natančnejšo analizo vzorcev prostorske transkripcije in združevanja celic.
-
Vnaprej pripravljene knjižnice DNBSEQ
DNBSEQ, ki ga je razvil MGI, je inovativna tehnologija NGS, ki ji je uspelo dodatno znižati stroške zaporedja in povečati prepustnost. Priprava knjižnic DNBSEQ vključuje fragmentacijo DNA, pripravo ssDNA in pomnoževanje kotalnega kroga, da dobimo nanokroglice DNA (DNB). Ti se nato naložijo na trdno površino in nato sekvencirajo s kombinatorično sintezo sonde-sidra (cPAS). Tehnologija DNBSEQ združuje prednosti nizke stopnje napak pri ojačanju z uporabo vzorcev napak visoke gostote z nanokroglicami, kar ima za posledico zaporedje z večjo prepustnostjo in natančnostjo.
Naša vnaprej izdelana storitev sekvenciranja knjižnic strankam omogoča pripravo knjižnic sekvenciranja Illumina iz različnih virov (med drugim mRNA, celotnega genoma, amplikona, knjižnic 10x), ki se v naših laboratorijih pretvorijo v knjižnice MGI za sekvenciranje v DNBSEQ-T7, kar omogoča velike količine podatkov pri nižjih stroških.
-
Kromatinska interakcija na osnovi Hi-C
Hi-C je metoda, zasnovana za zajemanje genomske konfiguracije s kombiniranjem sondiranja interakcij na podlagi bližine in visoko zmogljivega zaporedja. Metoda temelji na zamreženju kromatina s formaldehidom, čemur sledi digestija in ponovna ligacija na način, da le fragmenti, ki so kovalentno povezani, tvorijo ligacijske produkte. S sekvenciranjem teh produktov ligacije je mogoče preučevati 3D organizacijo genoma. Hi-C omogoča preučevanje porazdelitve delov genoma, ki so rahlo zapakirani (predelki A, evkromatin) in bolj verjetno, da bodo transkripcijsko aktivni, ter regij, ki so tesneje zapakirane (predelki B, heterokromatin). Hi-C se lahko uporablja tudi za natančno določanje topološko povezanih domen (TAD), regij genoma, ki imajo prepognjene strukture in imajo verjetno podobne vzorce izražanja, ter za identifikacijo kromatinskih zank, regij DNK, ki so skupaj zasidrane z beljakovinami in ki so pogosto obogatena z regulativnimi elementi. Storitev sekvenciranja Hi-C podjetja BMKGene omogoča raziskovalcem, da raziskujejo prostorske razsežnosti genomike, s čimer odpirajo nove poti za razumevanje regulacije genoma in njenih posledic za zdravje in bolezni.
-
Komplet TGuide Smart Magnetic Plant RNA
Komplet TGuide Smart Magnetic Plant RNA
Očistite visokokakovostno celotno RNK iz rastlinskih tkiv
-
Komplet TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA
Komplet TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA
Vnaprej napolnjen vložek/reagentni komplet plošče za čiščenje visokokakovostne skupne RNA brez zaviralcev iz živalskega tkiva/celice/sveže polne krvi z visokim izkoristkom, visoko čistostjo
-
Pametni magnetni komplet DNK rastlin TGuide
Pametni magnetni komplet DNK rastlin TGuide
Očistite visoko kakovostno genomsko DNK iz različnih rastlinskih tkiv
-
TGuide Smart Soil / Stool DNA Kit
TGuide Smart Soil / Stool DNA Kit
Očisti DNK brez inhibitorjev visoke čistosti in kakovosti iz vzorcev zemlje in blata
-
Pametni komplet za čiščenje DNK TGuide
Obnovi visoko kakovostno DNK iz produkta PCR ali agaroznih gelov.
-
Komplet TGuide Smart Blood Genomic DNA
Komplet TGuide Smart Blood Genomic DNA
Vnaprej napolnjen vložek/reagentni komplet plošče za čiščenje genomske DNA iz krvi in buffy plašča
-
Komplet TGuide Smart Magnetic Tissue DNA
Napolnjen reagentni komplet vložkov/plošč za ekstrakcijo genomske DNK iz živalskih tkiv
-
TGuide Smart Universal DNA Kit
Prednapolnjeni vložek/reagentni komplet za čiščenje genomske DNK iz krvi, posušenih madežev krvi, bakterij, celic, sline, ustnih brisov, živalskih tkiv itd.
-
Ekstraktor nukleinskih kislin TGuide S16
Ekstraktor nukleinskih kislin TGuide S16
Namizni instrument, enostaven za uporabo, 1–8 ali 16 vzorcev hkrati
Kataloška številka / pakiranje
mačka št
ID
št. priprav
OSE-S16-AM
1 komplet
-
PacBio 2+3 raztopina mRNA polne dolžine
Medtem ko je sekvenciranje mRNA na osnovi NGS vsestransko orodje za kvantifikacijo izražanja genov, njegovo zanašanje na kratke odčitke omejuje njegovo učinkovitost pri kompleksnih transkriptomskih analizah. Po drugi strani PacBio sekvenciranje (Iso-Seq) uporablja tehnologijo dolgega branja, ki omogoča sekvenciranje transkriptov mRNA polne dolžine. Ta pristop omogoča celovito raziskovanje alternativnega spajanja, zlitja genov in poliadenilacije, čeprav ni primarna izbira za kvantifikacijo izražanja genov. Kombinacija 2+3 premosti vrzel med Illumina in PacBio, tako da se zanaša na odčitke PacBio HiFi za identifikacijo celotnega niza izooblik transkriptov in sekvenciranje NGS za kvantificiranje identičnih izooblik.
Platforme: PacBio Sequel II/ PacBio Revio in Illumina NovaSeq;
