Bmkcloud prijava

Močna orodja za analizo

wps_doc_13

Toplotna karta

Orodje HeatMap sprejema podatkovno datoteko matrice kot vhod in uporabnikom omogoča filtriranje, normalizacijo in združevanje podatkov. Primarni primer uporabe za toplotne karte je grozdna analiza ravni ekspresije genov med različnimi vzorci.

 

wps_doc_14

Gensko opombo

Orodje za zapisovanje genov izvaja gensko opombo, ki temelji na poravnavi zaporedja vhodnih datotek FASTA proti različnim bazam podatkov.

wps_doc_15

Osnovno lokalno orodje za iskanje poravnave (BLAST)

Orodje BLAST je integrirana različica BMKCloud NCBI Blast in se lahko uporablja za izvajanje istih funkcij z uporabo podatkov, naloženih na račun BMKCloud.

wps_doc_16

Napoved CDS_UTR

Orodje za napovedovanje CDS_UTR je zasnovano za napovedovanje kodirnih regij (CDS) in nekodiranih regij (UTR) v danih sekvencah transkriptov, ki temeljijo na rezultatih BLAST v primerjavi z znanimi bazami podatkov beljakovin in rezultati napovedovanja ORF.

wps_doc_17

Manhattanski zaplet

Orodje za parcelo Manhattan omogoča prikaz visokih vzorčnih eksperimentov in se običajno uporablja v študijah povezave na celotnem genomu (GWA).

wps_doc_18

Shema cirsos

Orodje Circos Diagram zagotavlja učinkovito vizualizacijo, kako se genomske značilnosti porazdelijo po genomu. Skupne značilnosti vključujejo kvantitativne lokuse, SNP, indele, strukturne in številčne različice kopij.

wps_doc_19

Obogatitev genske ontologije (GO)

Orodje za obogatitev GO zagotavlja funkcionalno analizo obogatitve. Primarna programska oprema v tem orodju je paket Topgo-BioConductor, ki vključuje analizo diferencialne ekspresije, analizo obogatitve GO in vizualizacijo rezultatov.

wps_doc_20

Analiza tehtane genske koekspresijske mreže (WGCNA)

WGCNA je široko uporabljena metoda rudarjenja podatkov za odkrivanje modulov za koekspresijo genov. Uporablja se za različne nabore izražanja, vključno z podatki o ekspresiji z mikroarro in gensko ekspresijo NGS.

wps_doc_17

Medproscan

 Orodje medproscana zagotavlja analizo in klasifikacijo zaporedja medprosorjev beljakovin.

 

wps_doc_21

Go Kegg obogatitev

Orodje za obogatitev GO KEGG je oblikovanje za ustvarjanje histograma obogatitve GO, histograma obogatitve KEGG in poti obogatitve KEGG, ki temelji na določenem genskem nizu in ustreznem pripisu.

Pridobite ponudbo

Tu napišite svoje sporočilo in nam ga pošljite

Pošljite nam svoje sporočilo: