Celostni pristopi v analizi mikrobioma
- Od ekstrakcije nukleinskih kislin do tehnologij sekvenciranja
Visoko zmogljive študije sekvenciranja mikrobnih skupnosti so postale zelo razširjene in so bistveno izboljšale naše razumevanje človeškega, okoljskega in živalskega mikrobioma.
Na tem spletnem seminarju Ana Vila-Santa, znanstvenica za terensko uporabo pri Biomarker Technologies, razpravlja o dveh temeljnih metodah sekvenciranja, ki sta ključni za raziskave mikrobioma: sekvenciranje amplikonov in metagenomika šibrovke. Vodi nas skozi primerjalno analizo tehnologij zaporedja s kratkim branjem (npr. Illumina) in dolgo branjem (npr. Nanopore, PacBio), pri čemer ocenjuje njihovo učinkovitost za različne študijske cilje.
Po tem dr. Cui, produktni vodja ekipe za izvozni trg TIANGEN, preide na napredek na področju avtomatiziranih rešitev za ekstrakcijo nukleinske kisline. Raziskuje načela, metode in izzive, povezane z vzorci mikroorganizmov, kar doseže vrhunec z uvedbo najsodobnejše platforme za avtomatsko ekstrakcijo nukleinske kisline (NAE). Dr. Cui ponuja poglobljen pregled celovite rešitve TIANGEN za pripravo vzorcev in analizo nukleinske kisline v raziskavah mikrobioma, s čimer obravnava prihodnje izzive in izboljšave.