Genom
Sestavljanje in analiza kromosoma-lestvice genoma biomase Miscanthus lutarioriparius
Nanopore zaporedje | Illumina | Hi-c | Sekvenciranje RNA | Filogenija
V tej raziskavi so Biomarker Technologies nudile tehnično podporo pri zaporedju nanopore, de novo genome, sestavljanje HI-C, asistent, itd.
Izvleček
Miscanthus, Rhizomatozna trajnica, ima velik potencial za proizvodnjo bioenergije za visoko biomaso in stresno toleranco. Poročamo o kromosomuMiscanthus lutarioripariusgenom s kombiniranjem sekvenciranja nanopore Oxford in tehnologij HI-C. 2.07 GB sklopa zajema 96,64% genoma, s Contig N50 1,71 MB. Sekvence Centromere in Telomere so sestavljene za vseh 19 kromosomov in kromosoma 10. Alotetraploidni izvor M. lutarioriparius je konfiniran s pomočjo centromernih satelitskih ponovitev. Jasno so prikazani tetraploidna struktura genoma in več kromosomskih preureditev glede na sirko. Tandemski podvojeni geniM. Lutarioripariusso funkcionalno obogateni ne le v smislu, povezani z odzivom na stres, temveč biosintezo celične stene. Genske družine, povezane z odpornostjo na bolezni, biosintezo celične stene in transport kovinskih ionov, se močno razširijo in razvijajo. Širitev teh družin je lahko pomembna genomska podlaga za izboljšanje izjemnih lastnostiM. Lutarioriparius.
Ključna statistika sestavljanja genoma
Slika. Pregled sklopa genoma M. lutarioriparius
Novice in poudarki Cilj je deliti najnovejše uspešne primere z biomarkerskimi tehnologijami, zajemati nove znanstvene dosežke in vidne tehnike, ki se uporabljajo med študijo.
Čas objave: januar-05-2022