lncrna

Dolge nekodirajoče RNA (lncRNA) so RNA, daljše od 200 nukleotidov z nizkim kodirnim potencialom, vendar s kritičnimi regulativnimi funkcijami. Cevovod BMKCloud lncRNA je zasnovan za analizo knjižnic, osiromašenih rRNA, z visokokakovostnim, dobro označenim referenčnim genomom, tako da skupaj analizira ekspresijo lncRNA in mRNA. Po obrezovanju odčitavanja in nadzoru kakovosti se odčitki uskladijo z referenčnim genomom za sestavljanje transkriptov, poznejša analiza genske strukture pa razkrije alternativno spajanje in nove gene. Transkripti so identificirani kot mRNA ali lncRNA, analiza diferencialne ekspresije pa identificira različno izražene lncRNA, njihove tarče in različno izražene gene (DEGS). Tako DEG kot različno izražene tarče lncRNA so funkcionalno označene, da bi našli obogatene funkcionalne kategorije.