Cilj genomske asociacijske študije (GWAS) je identificirati genetske različice (genotip), ki so povezane s posebnimi lastnostmi (fenotip). Študije GWA raziskujejo genetske označevalce, ki prečkajo celoten genom velikega števila posameznikov in napovedujejo povezave genotipa in fenotipa s statistično analizo na ravni populacije. Ponovno zaporedje celotnega genoma lahko potencialno odkrije vse genetske različice. Skupaj s fenotipskimi podatki je GWAS mogoče obdelati za identifikacijo SNP-jev, QTL-jev in kandidatnih genov, povezanih s fenotipom, kar močno podpira sodobno vzrejo živali/rastlin. SLAF je samorazvita poenostavljena strategija sekvenciranja genoma, ki odkriva označevalce, porazdeljene po celotnem genomu, SNP. Te SNP-je kot molekularne genetske markerje je mogoče obdelati za asociacijske študije s ciljnimi lastnostmi. Je stroškovno učinkovita strategija pri prepoznavanju kompleksnih lastnosti, povezanih z genetskimi variacijami.
