Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Izdelki

Vnaprej izdelane knjižnice Illumina

Tehnologija Illumina Sequencing, ki temelji na sekvenciranju s sintezo (SBS), je globalno sprejemana inovacija NGS, odgovorna za ustvarjanje več kot 90% svetovnih podatkov o zaporedju. Načelo SBS vključuje slikanje fluorescentno označenih reverzibilnih terminatorjev, ko je dodan vsak DNTP, in nato cepimo, da se omogoči vključitev naslednje baze. Z vsemi štirimi reverzibilnimi DNTP, vezanimi na Terminator, ki so prisotni v vsakem ciklu zaporedja, naravna konkurenca zmanjša pristranskost vključitve. Ta vsestranska tehnologija podpira tako knjižnice z enim branjem kot v paru, ki skrbi za vrsto genomskih aplikacij. Zmogljivosti za visoko prepustnost Illumina Sequencing in natančnost sta postavljajo kot temeljni kamen v genomični raziskavi, ki omogočajo znanstvenikom, da razkrijejo zapletenosti genomov z neprimerljivimi podrobnostmi in učinkovitostjo.

Naša predhodno izdelana storitev sekvenciranja knjižnic omogoča strankam, da pripravijo knjižnice za zaporedje iz različnih virov (mRNA, celoten genom, amplikon, 10x knjižnice). Nato lahko te knjižnice pošljemo v naše zaporedne centre za nadzor kakovosti in zaporedje na platformah Illumina.


Podrobnosti o storitvi

Demo rezultat

Lastnosti

Platforme:Illumina Novaseq 6000 in Novaseq X Plus

Načini zaporedja:PE150 in PE250

Nadzor kakovosti knjižnic pred zaporedjem

Podatki o zaporedju QC in dostava:Dostava poročila QC in surovih podatkov v formatu FASTQ po demultipleksiranju in filtriranju Q30 Readi

 

 

Prednosti storitev

Vsestranskost zaporednih storitev:Stranka se lahko odloči za zaporedje po voznem pasu, pretočni celici ali s količino potrebnih podatkov (delno zaporedje voznega pasu).

Obsežne izkušnje na platformi za sekvenciranje Illumina:s tisoči zaprtih projektov z različnimi vrstami. 

Dostava zaporedja poročila QC:Z meritvami kakovosti, natančnostjo podatkov in splošno uspešnostjo projekta sekvenciranja.

Proces zrelega zaporedja:s kratkim obratovalnosti.

Strog nadzor kakovosti: Izvajamo stroge zahteve QC, da zagotovimo dosledno kakovostne rezultate.

 

 

Vzorčne platforme

Obnosišče

Pretočna celica

Način zaporedja

Enota

Ocenjeni izhod

Novaseq x

10B (8 pasov)

PE150

Enojni pas

Delni pas

375GB / LANE

25B (8 pasov)

PE150

Enojni pas

Delni pas

1000 GB/vozni pas

Novaseq 6000

SP pretočna celica (2 pasovi)

PE250

Pretočna celica

Enojni pas

Delni pas

325-400 m Reads / Lane

S4 pretočna celica (4 pasovi)

PE150

Pretočna celica

Enojni pas

Delni pas

~ 800 GB / LANE

Vzorčne zahteve

 

Znesek podatkov (x)

Koncentracija (qpcr/nm)

Glasnost

Delno zaporedje voznega pasu

 

 

X ≤ 10 GB

≥ 1 nm

≥ 25 μl

10 GB <x ≤ 50 GB

≥ 2 nm

≥ 25 μl

50 GB <x ≤ 100 GB

≥ 3 nm

≥ 25 μl

X> 100 GB

≥ 4 nm

≥ 25 μl

Zaporedje voznega pasu

Na vozni pas

≥ 1,5 nm / knjižnični bazen

≥ 25 μl / knjižnični bazen

Poleg koncentracije in skupne količine je potreben tudi primeren vrhovni vzorec.

OPOMBA: Zaporedje pasu knjižnic z nizko raznolikostjo zahteva Phix Spike-In, da se zagotovi robustna bazna klica.

Priporočamo, da kot vzorce predložimo knjižnice vnaprej. Če za izvajanje združevanja knjižnic potrebujete BMKGENE, glejte

Knjižnične zahteve za delno zaporedje voznega pasu.

Velikost knjižnice (najvišji zemljevid)

Glavni vrh mora biti znotraj 300-450 bp.
Knjižnice bi morale imeti en glavni vrhunec, brez kontaminacije adapterja in brez temeljnih premazov.

Prosimo, da se obrnite na nas, če vaši vzorci ne ustrezajo začetnim materialnim zahtevam.

Storitveni potek

Priprava vzorca

Nadzor kakovosti knjižnice

Zaporedje

Zaporedje

Analiza podatkov

Nadzor kakovosti podatkov

Vzorec QC

Dostava projektov


  • Prejšnji:
  • Naslednji:

  • Poročilo o knjižnici QC

    Poročilo o kakovosti knjižnice je navedeno pred sekvenciranjem, oceno zneska knjižnice in razdrobljenosti.

     

    Sekvenciranje poročila QC

     

    Tabela 1. Statistični podatki o sekvenčnih podatkih.

    Vzorčni ID

    Bmkid

    Surove bere

    Surovi podatki (BP)

    Čisti odčitki (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6.861.036.000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4.415.360.100

    96.00

    98,95

    93.89

    37.08

    Slika 1. Porazdelitev kakovosti vzdolž odčitkov v vsakem vzorcu

    A9

    Slika 2. Porazdelitev vsebine osnovne vsebine

    A10

    Slika 3. Porazdelitev vsebine branja v podatkih o zaporedju

    A11

     

    Pridobite ponudbo

    Tu napišite svoje sporočilo in nam ga pošljite

    Pošljite nam svoje sporočilo: