CircRNA

Krožne RNA (circRNA) so nekodirajoče RNA, ki tvorijo krožne strukture in imajo več regulativnih vlog, vključno s tekmovanjem z miRNA za ciljne gene in vezavo na beljakovine. Cevovod BMKCloud circRNA je zasnovan za analizo knjižnic, osiromašenih rRNA, z dobro označenim in visokokakovostnim referenčnim genomom. Analiza se začne z obrezovanjem branja in nadzorom kakovosti, čemur sledi poravnava branja z referenčnim genomom in napovedovanje novih circRNA, skupaj z identifikacijo znanih circRNA iz baz podatkov. Ustrezne tarče miRNA in gostitelji circRNA se nato identificirajo. Analiza diferencialne ekspresije razkrije različno izražene circRNA, ustrezni gostitelji pa so funkcionalno označeni, da izločijo obogatene biološke funkcije.