Malé RNA sú typ krátkej nekódujúcej RNA s priemernou dĺžkou 18-30 nt, vrátane miRNA, siRNA a piRNA. Tieto malé RNA sa hlásili, že sa masívne podieľajú na rôznych biologických procesoch, ako je degradácia mRNA, inhibícia translácie, tvorba heterochromatínu atď. Analýza sekvenovania SmallRNA sa široko uplatňuje v štúdiách vývoja zvierat/rastlín, choroby, vírusu atď. Platforma na analýzu sekvenovania pozostáva zo štandardnej analýzy a pokročilého ťažby údajov. Na základe údajov údajov RNA-Seq môže štandardná analýza dosiahnuť identifikáciu a predikciu miRNA, predikciu génov miRNA, anotáciu a analýzu expresie. Pokročilá analýza umožňuje prispôsobené vyhľadávanie a extrakciu miRNA, generovanie diagramu Venn, budovanie siete miRNA a cieľovej génovej siete.
