Malá RNA

Malé RNA sú krátke nekódujúce RNA s priemernou dĺžkou 18-30 nt, vrátane miRNA, siRNA a piRNA, ktoré hrajú dôležité úlohy v regulačných procesoch. Potrubie sRNA BMKCloud poskytuje štandardnú aj vlastnú analýzu na identifikáciu miRNA. Po orezaní čítania a kontrole kvality sa čítania zarovnajú s viacerými databázami, aby sa klasifikovali sRNA a vybrali miRNA a mapovali sa do referenčného genómu. miRNA sú identifikované na základe známych miRNA databáz, ktoré poskytujú informácie o sekundárnej štruktúre, rodine miRNA a cieľových génoch. Analýza diferenciálnej expresie identifikuje rozdielne exprimované miRNA a zodpovedajúce cieľové gény sú funkčne označené, aby sa našli obohatené kategórie.