-
BMKMANU S3000_Priestorový prepis
Priestorová transkriptomika stojí v popredí vedeckých inovácií a umožňuje výskumníkom ponoriť sa do zložitých vzorcov génovej expresie v tkanivách pri zachovaní ich priestorového kontextu. Uprostred rôznych platforiem spoločnosť BMKGene vyvinula čip BMKManu S3000 Spatial Transscriptome Chip, ktorý sa môže pochváliť vylepšeným rozlíšením 3,5 µm, ktorý dosahuje subcelulárny rozsah a umožňuje nastavenie viacerých úrovní rozlíšenia. Čip S3000 s približne 4 miliónmi škvŕn využíva mikrojamky navrstvené guľôčkami naplnenými priestorovými zachytávacími sondami s čiarovým kódom. Z čipu S3000 je pripravená knižnica cDNA obohatená o priestorové čiarové kódy a následne sekvenovaná na platforme Illumina NovaSeq. Kombinácia priestorovo kódovaných vzoriek a UMI zaisťuje presnosť a špecifickosť generovaných údajov. Čip BMKManu S3000 je mimoriadne všestranný a ponúka viacúrovňové nastavenia rozlíšenia, ktoré možno jemne doladiť pre rôzne tkanivá a požadovanú úroveň detailov. Táto prispôsobivosť predstavuje čip ako vynikajúcu voľbu pre rôzne štúdie priestorovej transkriptomiky, čím sa zabezpečuje presné priestorové zoskupovanie s minimálnym šumom. Použitie technológie bunkovej segmentácie s BMKManu S3000 umožňuje ohraničenie transkripčných údajov k hraniciam buniek, výsledkom čoho je analýza, ktorá má priamy biologický význam. Okrem toho vylepšené rozlíšenie S3000 vedie k vyššiemu počtu génov a UMI detegovaných na bunku, čo umožňuje oveľa presnejšiu analýzu priestorových transkripčných vzorov a zhlukovanie buniek.
-
Vopred pripravené knižnice DNBSEQ
DNBSEQ, vyvinutý spoločnosťou MGI, je inovatívna technológia NGS, ktorej sa podarilo ďalej znížiť náklady na sekvenovanie a zvýšiť priepustnosť. Príprava knižníc DNBSEQ zahŕňa fragmentáciu DNA, prípravu ssDNA a amplifikáciu rotujúceho kruhu na získanie nanoguľôčok DNA (DNB). Tie sa potom nanesú na pevný povrch a následne sa sekvenujú kombinatorickou syntézou sondy a kotvy (cPAS). Technológia DNBSEQ kombinuje výhody nízkej chybovosti zosilnenia s použitím vzorov chýb s vysokou hustotou s nanoguličkami, čo vedie k sekvenovaniu s vyššou priepustnosťou a presnosťou.
Naša vopred pripravená služba sekvenovania knižníc umožňuje zákazníkom pripraviť sekvenačné knižnice Illumina z rôznych zdrojov (okrem iného mRNA, celý genóm, amplikón, knižnice 10x), ktoré sa prevedú na knižnice MGI v našich laboratóriách, aby sa sekvenovali v DNBSEQ-T7, čo umožňuje vysoký objem dát pri nižších nákladoch.
-
Hi-C založená chromatínová interakcia
Hi-C je metóda navrhnutá na zachytenie genómovej konfigurácie kombináciou sondovania interakcií založených na blízkosti a vysoko výkonného sekvenovania. Metóda je založená na zosieťovaní chromatínu s formaldehydom, po ktorom nasleduje štiepenie a opätovná ligácia takým spôsobom, že len fragmenty, ktoré sú kovalentne spojené, vytvoria produkty ligácie. Sekvenovaním týchto ligačných produktov je možné študovať 3D organizáciu genómu. Hi-C umožňuje študovať distribúciu častí genómu, ktoré sú ľahko zbalené (kompartmenty A, euchromatín) a s väčšou pravdepodobnosťou sú transkripčne aktívne, a oblasti, ktoré sú tesnejšie zbalené (kompartmenty B, heterochromatín). Hi-C možno použiť aj na určenie topologicky asociovaných domén (TAD), oblastí genómu, ktoré majú zložené štruktúry a pravdepodobne majú podobné vzory expresie, a na identifikáciu chromatínových slučiek, oblastí DNA, ktoré sú navzájom ukotvené proteínmi a ktoré sú často obohatené o regulačné prvky. Služba sekvenovania Hi-C od BMKGene umožňuje výskumníkom preskúmať priestorové dimenzie genomiky, čím sa otvárajú nové cesty na pochopenie regulácie genómu a jej dôsledkov na zdravie a choroby.
-
Súprava TGuide Smart Magnetic Plant RNA
Súprava TGuide Smart Magnetic Plant RNA
Vyčistite vysokokvalitnú celkovú RNA z rastlinných tkanív
-
Súprava TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA Kit
Súprava TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA Kit
Vopred naplnená kazeta/doštička reagenčná súprava na čistenie vysoko výťažnej, vysoko čistej, kvalitnej celkovej RNA bez inhibítorov zo živočíšneho tkaniva/buniek/čerstvej plnej krvi
-
Inteligentná magnetická súprava DNA rastlín TGuide
Inteligentná magnetická súprava DNA rastlín TGuide
Vyčistite vysokokvalitnú genómovú DNA z rôznych rastlinných tkanív
-
TGuide Smart Soil/Stool DNA Kit
TGuide Smart Soil/Stool DNA Kit
Čistí DNA bez inhibítorov vysokej čistoty a kvality zo vzoriek pôdy a stolice
-
Súprava na čistenie DNA TGuide Smart
Obnovuje vysokokvalitnú DNA z produktu PCR alebo agarózových gélov.
-
Súprava TGuide Smart Blood Genomic DNA
Súprava TGuide Smart Blood Genomic DNA
Vopred naplnená kazeta/doštička reagenčná súprava na purifikáciu genómovej DNA z krvi a buffy coat
-
Súprava inteligentného magnetického tkaniva DNA TGuide
Vopred naplnená kazeta / reagenčná súprava na extrakciu genómovej DNA zo živočíšnych tkanív
-
TGuide Smart Universal DNA Kit
Vopred naplnená kazeta/doštička reagenčná súprava na čistenie genómovej DNA z krvi, sušených krvných škvŕn, baktérií, buniek, slín, ústnych tampónov, tkanív zvierat atď.
-
Extraktor nukleových kyselín TGuide S16
Extraktor nukleových kyselín TGuide S16
Ľahko použiteľný stolný nástroj, 1-8 alebo 16 vzoriek súčasne
Katalógové číslo / balenie
Cat. č
ID
Počet príprav
OSE-S16-AM
1 sada
-
Roztok PacBio 2+3 s plnou dĺžkou mRNA
Zatiaľ čo sekvenovanie mRNA na báze NGS je všestranným nástrojom na kvantifikáciu génovej expresie, jeho spoliehanie sa na krátke čítania obmedzuje jeho účinnosť v komplexných transkriptomických analýzach. Na druhej strane sekvenovanie PacBio (Iso-Seq) využíva technológiu dlhého čítania, ktorá umožňuje sekvenovanie transkriptov mRNA s plnou dĺžkou. Tento prístup uľahčuje komplexný prieskum alternatívneho zostrihu, génových fúzií a polyadenylácie, hoci to nie je primárna voľba na kvantifikáciu génovej expresie. Kombinácia 2+3 premosťuje priepasť medzi Illumina a PacBio spoliehaním sa na čítania PacBio HiFi na identifikáciu kompletnej sady transkriptových izoforiem a sekvenovania NGS na kvantifikáciu identických izoforiem.
Platformy: PacBio Sequel II/ PacBio Revio a Illumina NovaSeq;
