Zvýraznenie
V rámci tohto dvojhodinového webinára je našou veľkou cťou pozvať šiestich odborníkov v oblasti genomiky plodín. Naši rečníci poskytnú hĺbkovú interpretáciu dvoch Ryeových genomických štúdií, ktoré boli nedávno publikovanéPrírodná genetika:
1. Zostava genómu na úrovni chromozómov poskytuje pohľad na biológiu raže, evolúciu a agronomický potenciál
2. Vysokokvalitná zostava genómu zvýrazňuje genómové vlastnosti raže a agronomicky dôležité gény
Tiež sme radi, že máme vedúceho výskumného a vývojového vedca z Biomarker Technologies, ktorý sa podelí o svoje skúsenosti s de novo zostavovaním genómu.
Agenda
09:00 SEČ
Uvítacie poznámky
Zheng Hong-kun
Zakladateľ a generálny riaditeľ Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Prezident Školy pokročilých poľnohospodárskych vied Pekingskej univerzity
09:15
Zlepšenie zlepšenia raže, tritikale a pšenice pomocou vysokokvalitnej referenčnej sekvencie genómu
V tomto webinári nám Prof. Wang poskytol celkové aktualizácie o súčasnom stave genómového výskumu triticeae a demonštroval úspech a prelomy dvoch vynikajúcich prác o štúdiách genómu Rye, ktoré boli len nedávno publikované na Nature Genetics a predstavujú celý výskum. skupiny, ktoré vedú a prispievajú k práci.
09:25
Genomika obilnín @ IPK Gatersleben
Obilné trávy kmeňa Triticeae boli hlavným zdrojom potravy v oblastiach mierneho pásma, ktoré sa dlho považovali za hotspot pri zlepšovaní a šľachtení plodín. Spomedzi všetkých pestovaných druhov je tento kmeň známy svojimi mimoriadne zložitými genómovými znakmi vrátane veľkých veľkostí genómu, vysokého obsahu TE, polyploidie atď. genomický výskum@IPK Gatersleben.
09:35
Zostava genómu na úrovni chromozómov poskytuje pohľad na biológiu raže, evolúciu a agronomický potenciál
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plan Research (IPK)Raž (Secale cereale L.) je obilnina mimoriadne odolná voči klimatickým zmenám, ktorá sa vo veľkej miere používa na produkciu vylepšených odrôd pšenice prostredníctvom introgresívnej hybridizácie a má celý repertoár génov potrebných na umožnenie hybridného šľachtenia. Raž je alogamná a len nedávno domestikovaná, čo umožňuje pestovanej raži prístup k rozmanitému a využiteľnému divokému genofondu. Aby sme ďalej zvýšili agronomický potenciál raže, vytvorili sme anotovanú zostavu 7,9 Mbp genómu raže v chromozómovom meradle a rozsiahlo sme overili jeho kvalitu pomocou sady molekulárnych genetických zdrojov. Využitie tohto zdroja demonštrujeme na širokej škále výskumov. Uvádzame zistenia o neúplnej genetickej izolácii kultivovanej raže od divokých príbuzných, mechanizmoch štrukturálnej evolúcie genómu, rezistencii voči patogénom, nízkej teplotnej tolerancii, systémoch kontroly plodnosti pre hybridné šľachtenie a prínosoch introgresií raže a pšenice.
10:05
Vysokokvalitná zostava genómu zvýrazňuje genómové vlastnosti raže a agronomicky dôležité gény
Raž je cenná potravinová a kŕmna plodina, dôležitý genetický zdroj pre zlepšenie pšenice a tritikale a nepostrádateľný materiál pre efektívne porovnávacie genomické štúdie tráv. Tu sme sekvenovali genóm raže Weining, elitnej čínskej odrody raže. Zostavené kontigy (7,74 Gb) predstavovali 98,47 % odhadovanej veľkosti genómu (7,86 Gb), pričom 93,67 % kontigov (7,25 Gb) bolo priradených siedmim chromozómom. Opakujúce sa prvky tvorili 90,31 % zostaveného genómu. V porovnaní s predtým sekvenovanými genómami Triticeae vykazovali retrotranspozóny Daniela, Sumaya a Sumana silnú expanziu v raži. Ďalšie analýzy Weiningovej montáže vrhajú nové svetlo na duplikácie génov v celom genóme a ich vplyv na gény biosyntézy škrobu, fyzikálne organizácie komplexných lokusov prolamínu, znaky génovej expresie, ktoré sú základom skorého znaku hlavičky, a predpokladané chromozomálne oblasti a lokusy v raži spojené s domestikáciou. Táto sekvencia genómu sľubuje urýchlenie genomických a šľachtiteľských štúdií raže a príbuzných obilnín.
10:35
Výzvy, riešenia a budúcnosť zostavovania genómu de novo
Genóm vysokej kvality je základom genómového štúdia. Hoci rýchly vývoj v sekvenovaní a algoritme umožnil oveľa jednoduchšie a efektívnejšie zostavovanie genómu, požiadavky na presnosť a úplnosť zostavovania tiež stúpajú s prehlbovaním výskumných cieľov. V tejto prednáške rozoberiem súčasné populárne technológie v zostavovaní genómu s niekoľkými úspešnými prípadmi a nahliadnem do budúceho vývoja.
Čas odoslania: Jan-08-2022