Eukaryotické sekvenovanie mRNA-NG
Funkcie
● Zachytenie poly mRNA pred prípravou knižnice
● Voliteľná príprava knižnice mRNA, ktorá umožňuje získanie údajov o sekvencovaní špecifických pre prameň
● Bioinformatická analýza génovej expresie a transkripčnej štruktúry
Výhody
●Rozsiahla odbornosť: Náš tím spracoval viac ako 600 000 vzoriek v BMKGene, preklenuje rôzne typy vzoriek, ako sú bunkové kultúry, tkanivá a telesné tekutiny. Do každého projektu prinášame množstvo skúseností a úspešne sme dokončili viac ako 100 000 projektov mRNA-seq v rôznych výskumných doménach.
●Prísna kontrola kvality: Implementujeme základné kontrolné body vo všetkých fázach, od prípravy vzorky a knižnice po sekvenovanie a bioinformatiku. Toto dôkladné monitorovanie zaisťuje dodanie neustále vysokokvalitných výsledkov a uisťuje vás, že váš projekt je v spoľahlivých rukách.
●Komplexná anotácia: Používame viac databáz na funkčné anotácie diferencovane exprimovaných génov (DEGS) a vykonávanie zodpovedajúcich analýz obohatenia. Tento komplexný prístup poskytuje pohľad na bunkové a molekulárne procesy, ktoré sú základom transkripčnej reakcie, čím sa zabezpečí, že ste plne informovaní o výsledkoch vášho projektu.
●Podpora po predaji: Náš záväzok presahuje dokončenie projektu s 3-mesačným obdobím po predaji. Počas tejto doby ponúkame následné opatrenia projektu, pomoc pri riešení problémov a relácie otázok a odpovedí na riešenie akýchkoľvek otázok týkajúcich sa výsledkov.
Požiadavky a dodanie vzorky
| Knižnica | Stratégia | Odporúčané údaje | Kontrola kvality |
| Poly A obohatený | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 GB | Q30≥85% |
Vzorové požiadavky:
Nukleotidy:
| Conc. (Ng/μl) | Množstvo (μg) | Čistota | Integrita | |
| Štandardná knižnica | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Obmedzená alebo žiadna kontaminácia proteínu alebo DNA znázornená na géli. | Pre rastliny: RIN≥4,0; Pre zvieratá: RIN≥4,5; 5,0≥28s/18s≥1,0; obmedzené alebo žiadne základné vyvýšenie |
| Smerová knižnica | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Obmedzená alebo žiadna kontaminácia proteínu alebo DNA znázornená na géli. | Pre rastliny: RIN≥4,0; Pre zvieratá: RIN≥4,5; 5,0≥28s/18s≥1,0; obmedzené alebo žiadne základné vyvýšenie |
● Rastliny:
Koreň, kmeň alebo okvetné lístky: 450 mg
List alebo semeno: 300 mg
Ovocie: 1,2 g
●Zviera:
Srdce alebo črevo: 300 mg
Viscera alebo mozog: 240 mg
Sval: 450 mg
Kosti, vlasy alebo pokožka: 1g
● Činníky:
Hmyz: 6g
Crustacea: 300 mg
● Celá krv: 1 trubica
● Bunky: 106 bunky
Odporúčané doručenie vzorky
Nádoba: 2 ml centrifugačná trubica (cínová fólia sa neodporúča)
Vzorové označovanie: skupina+replikujte EG A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Zásielka:
1. Suchý ľad: Vzorky musia byť zabalené do vreckov a zakorenené v suchom ľade.
2. RADY RNAS TABUĽKY: Vzorky RNA sa môžu sušiť v RNA stabilizačnej trubici (napr. RNASTABLE®) a dodávané v miestnosti.
Pracovný tok služieb
Experimentálny návrh
Dodanie vzorky
Extrakcia RNA
Konštrukcia knižnice
Sekvenovanie
Analýza údajov
Služby po predaji
Bioinformatika
Eukaryotický MRNA Sekvencovanie analýzy pracovného postupu
Bioinformatika
ØRiadenie kvality nespracovaných údajov
ØReferenčné genómové vyrovnanie
ØAnalýza prepisu štruktúry
ØKvantifikácia výrazu
ØAnalýza diferenciálnej expresie
ØAnotácia funkcie a obohatenie
Referenčné genómové vyrovnanie
Nasýtenie údajov
Korelácia vzorky a hodnotenie biologických replikátov
Diferenčne exprimované gény (DEGS)
Funkčná anotácia stupňov
Funkčné obohatenie stupňov
Preskúmajte pokroky uľahčené spoločnosťou BMKGENE'S Eukaryotic NGS MRNA sekvencovanie služieb prostredníctvom kurátorskej zbierky publikácií.
Huang, L. a kol. (2023) „Triclosan a Triclocarban oslabujú čuchovú kapacitu zlatých rybiek obmedzením rozpoznávania zápachu, narušením transdukcie čuchového signálu a rušivým spracovaním čuchových informácií“, vodný výskum, 233, s. 119736. Doi: 10.1016/j.watres.2023.119736.
Jia, LJ a kol. (2023) „Aspergillus fumigatus unesie ľudský p11, aby presmeroval fagozómy obsahujúce hubami do nedegradatívnej dráhy“, bunkový hostiteľ a mikrób, 31 (3), s. 373-388.E10. doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
Jin, K. a kol. (2022) „Transkripčné faktory TCP zapojené do vývoja výhonku MA bambusu (Dendrocalamus latiflorus munro)“, Frontiers in Plant Science, 13, s. 884443. Doi: 10,3389/fpls.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. a kol. (2022) „Genóm Chrysanthemum Lavandulifolium a molekulárny mechanizmus, ktorý je základom rôznych typov kapitálu“, Horticulture Research, 9. doi: 10,1093/h/uhab022.
Zhang, Yujie a kol. (2023) „Kaskádový nanoreaktor na zlepšenie sonodynamickej terapie pri kolorektálnom karcinóme prostredníctvom synergického rozširovania ROS a zablokovania autofágy“, Nano Today, 49, s. 101798. Doi: 10,016/j.nantod.2023.101798.
