Vopred pripravené knižnice DNBSEQ
Vlastnosti
●Platforma:MGI-DNBSEQ-T7
●Režimy sekvenovania:PE150
●Presun knižníc Illumina doMGI:umožňujúce sekvenovanie veľkých objemov dát pri nízkych nákladoch.
●Kontrola kvality knižníc pred sekvenovaním.
●Sekvenčné údaje QC a doručenie:doručenie správy o kontrole kvality a nespracovaných údajov vo formáte fastq po demultiplexovaní a filtrovaní čítaní Q30.
Výhody
●Všestrannosť služieb sekvenovania:zákazník si môže zvoliť postupnosť podľa pruhu alebo množstva údajov.
●Vysoký dátový výstup:1500 Gb/pruh
●Doručenie správy o sekvenčnej kontrole kvality:s metrikami kvality, presnosťou údajov a celkovým výkonom projektu sekvenovania.
●Vyspelý proces sekvenovania:s krátkou dobou obratu.
●Prísna kontrola kvality: Implementujeme prísne požiadavky na kontrolu kvality, aby sme zaručili poskytovanie trvalo vysokokvalitných výsledkov.
Vzorové požiadavky
| Množstvo údajov (X) | Koncentrácia (qPCR/nM) | Objem | |
| Čiastočný jazdný pruh
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | > 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | > 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | > 4 nM | ||
| Single Lane | Per Lane | ≥ 1,5 nM / súbor knižnice | ≥ 25 μl / fond knižnice |
Okrem koncentrácie a celkového množstva je potrebný aj vhodný vzor vrcholu.
Poznámka: Sekvenovanie jazdných pruhov knižníc s nízkou diverzitou vyžaduje pripojenie PhiX, aby sa zabezpečilo robustné volanie základne.
Odporúčame odoslať vopred združené knižnice ako vzorky. Ak požadujete, aby BMKGENE vykonala združovanie knižníc, pozrite si dokument
požiadavky knižnice na čiastočné radenie jazdných pruhov.
Veľkosť knižnice (mapa vrcholu)
Hlavný vrchol by mal byť v rozmedzí 300-450 bp.
Knižnice by mali mať jeden hlavný vrchol, žiadnu kontamináciu adaptéra a žiadne diméry primerov.
Pracovný postup služby
Správa QC knižnice
Správa o kvalite knižnice sa poskytuje pred sekvenovaním, posúdením množstva knižnice a fragmentácie.
Správa o sekvenovaní kontroly kvality
Tabuľka 1. Štatistika údajov o sekvenovaní.
| ID vzorky | BMKID | Surové čítanie | Nespracované údaje (bp) | Čisté čítania (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Obrázok 1. Distribúcia kvality pozdĺž meraní v každej vzorke
Obrázok 2. Základná distribúcia obsahu
Obrázok 3. Distribúcia čítaného obsahu v sekvenčných dátach
